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HD5000 多譜超分辨菌落成像系統(tǒng)
HD5000多譜超分辨菌落成像系統(tǒng)是迅數(shù)科技2020出品,、軟硬件**配置的旗艦機(jī)型,，符合人體工學(xué)的全金屬機(jī)箱設(shè)計(jì)，精致,、堅(jiān)固,。
獨(dú)特設(shè)計(jì)的平皿萊因伯格照明系統(tǒng)，具有156種組合照明模式,，可為平皿,、多孔板菌落、細(xì)胞克隆,、病毒蝕斑拍攝華美的影像,，是圖像數(shù)據(jù)保存、文獻(xiàn)發(fā)表的有力工具,。
4/3英寸超大面陣CMOS傳感器與大視場高清定焦鏡頭搭配,，菌落影像通透、色彩細(xì)膩,，**展現(xiàn)培養(yǎng)基深層微小菌落,，抑菌圈輪廓清晰、銳利,，保證了圖像分割的精度和重現(xiàn)性,。
軟件功能豐富、易用,，融菌落計(jì)數(shù),、抑菌圈測量、菌種篩選三大功能于一體,?？蓪?shí)現(xiàn)：快速統(tǒng)計(jì)、多算法高級統(tǒng)計(jì),、網(wǎng)格濾膜,、3M測試片、典型菌篩選,、菌株特性描述,、雙圈分析、抑菌圈測量,。,。,。
微生物平皿成像的“數(shù)字影棚”
l“數(shù)字影棚”的光源控制
專業(yè)設(shè)計(jì)的平皿載樣艙，可實(shí)現(xiàn)培養(yǎng)皿的霧光漫反射照明,、懸浮暗視野照明,、彩色凌透背光照明、多譜萊茵伯格照明,，紫外激發(fā)照明,，拍出不同尋常的科研級精美照片。
光源控制器采用隱藏式吸彈門設(shè)計(jì),，具6路照明選擇開關(guān),、4通道無級亮度調(diào)節(jié)、雙通道色溫調(diào)節(jié),、12路彩色背景選擇,、12路萊因伯格光選擇。
l多譜萊因伯格照明
多譜萊因伯格照明是迅數(shù)**的平皿大視場暗域照明技術(shù),，12通道不同波長的可見激發(fā)光以環(huán)幕逆透射聚光照明菌落,，輔以不同的彩色凌透光，可構(gòu)成156種組合照明模式,，使培養(yǎng)基形成均勻的背景色,，菌落勾勒出鮮亮的自然色澤與輪廓。
無需化學(xué)染色,，即可使菌落或細(xì)胞克隆實(shí)現(xiàn)無損光著色,，便于觀察細(xì)微結(jié)構(gòu)，識別,、計(jì)數(shù),。
萊因伯格照明實(shí)際樣張：
l懸浮式暗視野照明
懸浮式暗視野由暗域輪廓光與黑色背景構(gòu)成。柔和的白色LED輪廓光,，使平皿中央到邊緣的菌落得到均勻的照明,，而光線幾乎穿透培養(yǎng)基，形成黑色背景下的亮色菌落,，菌落與培養(yǎng)基形成高反差，可清晰勾勒菌落輪廓,。
超分辨率 銳利展現(xiàn)菌落細(xì)節(jié)
1.1英寸大視場高清定焦鏡頭,，通過較大程度地控制多種像差，無論是暗視野照明,、霧光漫反射照明,、萊因伯格照明，都能呈現(xiàn)高分辨力,、高對比度的畫質(zhì),。
2100萬像素 4/3英寸超大面陣彩色SONY CMOS 傳感器，采用雙層降噪技術(shù)，具有極高的靈敏度以及超低噪聲,，能以無損圖像品質(zhì)呈現(xiàn)細(xì)微的色差和豐富的細(xì)節(jié)信息,。
高保真鏡頭與大面陣相機(jī)的**搭配，更能區(qū)分不同菌落,、菌落與雜質(zhì),、菌落與培養(yǎng)基之間的差異，從而提高菌落計(jì)數(shù),、篩選的精度,。
更多圖像算法 提高菌落計(jì)數(shù)精度
迅數(shù)創(chuàng)造性地研究出適合復(fù)雜菌落分割計(jì)數(shù)的快速活動輪廓模型、多相水平集活動輪廓模型等先進(jìn)的圖像分割技術(shù),，實(shí)現(xiàn)了復(fù)雜菌落,、高難度平皿的準(zhǔn)確計(jì)數(shù)。
(a) 水平集函數(shù)示意(b) 曲線演化過程
水平集活動輪廓模型的基本原理
圖像識別分割案例：
多粘連細(xì)菌菌落計(jì)數(shù)
微小菌的識別計(jì)數(shù)：適合支原體,、AMES ,、嗜冷菌分析
真菌菌落計(jì)數(shù)
濾膜菌落的識別計(jì)數(shù)
顯色菌落的識別計(jì)數(shù)
高效、精確 菌種數(shù)字化篩選
l無損傷的多譜光學(xué)染色識別技術(shù)
通過多光譜萊茵伯格照明的光學(xué)染色技術(shù),，讓菌落或克隆形成鮮艷的顏色,，便于觀察、辨別菌落的色彩和紋理細(xì)節(jié),，結(jié)合染色抗干擾精密統(tǒng)計(jì)技術(shù),，可以提高不同菌落識別的精度，減少培養(yǎng)基不平整,、雜質(zhì)干擾的影響,。
l不同菌群自動分類識別
微生物研究中有時(shí)需要在多菌混雜情況下把目標(biāo)菌分類統(tǒng)計(jì)出來。不同菌種菌落的色澤,、大小,、輪廓存在微小特征差異。
HD5000的“單色分類統(tǒng)計(jì),、指定多色篩選,、多色自動聚類”工具可實(shí)現(xiàn)高精度識別某一類菌落，或自動聚類區(qū)分不同顏色的菌落,。
l雙圈分析
通過精確測量透明外圈直徑和菌落直徑,，自動計(jì)算二者面積比和直徑比，并根據(jù)比值的大小自動排序,，定位出相應(yīng)的菌落,。適用于“抑菌圈、透明圈,、變色圈,、生長圈,、水解圈、溶磷圈,、排油圈,、溶鈣圈、溶血圈”分析,，輔助抗生素,、酶制劑、有機(jī)酸產(chǎn)生菌和石油,、農(nóng)藥降解菌的高效篩選,。
l病毒滴度分析-蝕斑/噬菌斑計(jì)數(shù)
懸浮式暗視野照明使得敏感細(xì)菌菌層為白色，烈性噬菌斑形成的透明斑為黑色,；萊茵伯格照明可讓結(jié)晶紫或中性紅染色的細(xì)胞層著色明艷,，病毒空斑更易觀察。影像的銳度與反差,，幫助實(shí)現(xiàn)蝕斑/噬菌斑的準(zhǔn)確分割和精確計(jì)數(shù),。
l菌絲生長速率分析工具
菌絲生長速率、菌絲生長抑制率,、對峙培養(yǎng)分析,、室內(nèi)毒力測定等實(shí)驗(yàn)常采用十字交叉法測量菌落直徑。由于多數(shù)霉菌菌落蔓延,、疏松,、邊緣發(fā)散不規(guī)則，測量的人為誤差大,，效率低,。迅數(shù)“霉菌一鍵測量”模塊，只需用“魔棒”在菌落邊緣點(diǎn)擊一次,，即可瞬間測出大霉菌的面積,、周長、長徑,、短徑,。
l免疫學(xué)研究
迅數(shù)-多區(qū)域統(tǒng)計(jì)算法可以輕松實(shí)現(xiàn)任意多個(gè)區(qū)域的同步一鍵計(jì)數(shù)，可用于肺炎鏈球菌莢膜多糖特異性抗體調(diào)理吞噬殺菌試驗(yàn)（OPKA）和抗體依賴補(bǔ)體介導(dǎo)的體外血清殺菌試驗(yàn)（SBA）
l多孔板克隆計(jì)數(shù)
高分辨率的HD5000還可用于多孔板的克隆成像,。萊茵伯格照明能使結(jié)晶紫染色的腫瘤或干細(xì)胞克隆鮮艷明亮,；懸浮式暗視野照明，可使軟瓊脂克隆形成高反差的圖像,，自動計(jì)數(shù)大于50um的克隆或細(xì)胞團(tuán)。
lSpot assay 點(diǎn)陣分析
Spot assay常用于檢測不同培養(yǎng)液中細(xì)菌或酵母的生長率,、培養(yǎng)液的連續(xù)梯度稀釋或某個(gè)菌株基因突變型的高通量篩選 ,?！?span>多區(qū)域動態(tài)調(diào)節(jié)統(tǒng)計(jì)”適用于此類分析。
抑菌圈自動測量
lSzone 抑菌圈多模式測量技術(shù)
抑菌圈測量常采用鋼圈雙碟法,、紙片法,、瓊脂打孔法，由于試驗(yàn)環(huán)節(jié)諸多因素,，如：抗生素溶液濃度,、培養(yǎng)基質(zhì)量、PH值,、試驗(yàn)菌菌齡,、培養(yǎng)時(shí)間等，使得*后形成的抑菌圈有些輪廓清晰,，有些邊緣模糊或不整齊并伴有破裂現(xiàn)象,。
迅數(shù)“自動檢測、擬圓逼近,、三點(diǎn)定圓”三種算法,，可適應(yīng)不同類型抑菌圈的測量。
l高對比,、高分辨成像---保證測量精度
抑菌圈測量的關(guān)鍵是準(zhǔn)確找到透明圈與底層菌的“邊界線”,。迅數(shù)**設(shè)計(jì)的懸浮式暗視野，使得透明的抑菌圈構(gòu)成“黑背景”,，與周邊灰白色的菌層形成高反差,。
測量精度取決于數(shù)字影像畫質(zhì)，而鏡頭與相機(jī)的組合對畫質(zhì)至關(guān)重要,。HD5000采用光學(xué)分辨率達(dá)150LP/mm的大靶面定焦鏡頭,，將通透無畸變的光信號通過4/3英寸大面陣CMOS芯片相機(jī)，轉(zhuǎn)為高清細(xì)膩的抑菌圈數(shù)字圖像,。
l抗生素效價(jià)測定
提供一劑量法,、二劑量法、三劑量法及合并計(jì)算,。一劑量法符合美國藥典,，二劑量法和三劑量法符合中國藥典2020版。儀器重復(fù)性自檢,，測量相對誤差≤0.002mm,；均勻性自檢，相對誤差≤0.1％,。
主要功能與技術(shù)指標(biāo)
一,、照明系統(tǒng)
?全封閉鋼鋁合金機(jī)箱（32×34×46cm）：精密、堅(jiān)固,，確保光密閉
?平皿載樣艙：下拉式鋁合金隔斷窗,，消除環(huán)境雜散光干擾,，阻斷紫外泄露、避免灰塵進(jìn)入
1)96顆LED列陣與納米反射材料構(gòu)成嵌入式霧光系統(tǒng),，360°連續(xù)漫反射,，凸顯菌落色澤和紋理，消除玻璃培養(yǎng)皿折射形成的光斑,、光環(huán),。
2)色溫變化范圍：3100K－5800K照度范圍 50-—7000 Lux
3)LED壽命≧20000 小時(shí)
白色LED光源，照度范圍 100—5500 Lux 顯色指數(shù)74%
?彩色（12色）凌透背光照明
1)可調(diào)式LED導(dǎo)光列陣,，形成均勻,、高亮的12種色彩透射光
2)照度均勻度大于90%，確保培養(yǎng)皿邊緣與中間得到均勻照明
1)12通道可見激發(fā)光,、環(huán)幕逆透射,，與凌透背光可構(gòu)成156種組合照明模式
2)多光譜模式可降低培養(yǎng)基不平整、色變的影響,，減少瓊脂雜質(zhì)的干擾
3)無損光著色技術(shù)與抗干擾精密統(tǒng)計(jì)技術(shù)結(jié)合,，增強(qiáng)菌落之間細(xì)微顏色差異辨別，顯著提高菌落識別,、篩選的精度
?紫外反射光源：254nm用于腔體消毒,、紫外誘變 ；366nm 可用于熒光激發(fā)
?光源控制器
1)隱形彈吸式控制面板,，6路照明選擇開關(guān),、4通道無級亮度調(diào)節(jié)、雙通道色溫調(diào)節(jié)
2)照明組合 自由切換
二,、數(shù)字成像
?1.1英寸大靶面高清工業(yè)定焦鏡頭,，鏡頭中央與邊緣都保持150 lp/mm的分辨率
?超大面陣CMOS相機(jī)： SONY 4/3英寸彩色CMOS 傳感器，
分辨率：2100萬像素
單像素尺寸：4.54X4.54um
三,、菌落分析模塊
1.基本菌落計(jì)數(shù)功能
?平皿類型：傾注,、涂布、膜濾,、螺旋平皿,、3M紙片
?全皿菌落統(tǒng)計(jì)：菌落總數(shù)統(tǒng)計(jì)，并按25檔尺寸分類顯示
?區(qū)域選擇統(tǒng)計(jì)：可選擇圓形,、矩形,、任意圈定區(qū)域進(jìn)行統(tǒng)計(jì)
?多域平行統(tǒng)計(jì)：一次性多區(qū)域同步統(tǒng)計(jì)；多區(qū)域“鏤空”統(tǒng)計(jì)
?直徑分類統(tǒng)計(jì)：設(shè)置直徑范圍,，統(tǒng)計(jì)特定大小的菌落
?鼠標(biāo)點(diǎn)擊統(tǒng)計(jì)：快速標(biāo)記,、添加菌落，適合培養(yǎng)皿邊緣菌落的計(jì)數(shù)
?菌落粘連分割：自動分割相互粘連的菌落，鏈狀菌落由用戶選擇分割或不分割
2.快速菌落統(tǒng)計(jì)
?滾輪參數(shù)調(diào)節(jié)統(tǒng)計(jì)（4種）：均質(zhì)平皿,、背景不均,、微小菌落、彩色背景
?一鍵響應(yīng)統(tǒng)計(jì)（3種）：單色統(tǒng)計(jì),、霉菌統(tǒng)計(jì)、反式統(tǒng)計(jì)
?偏差預(yù)估統(tǒng)計(jì)：適用于菌落顏色多且復(fù)雜的情況。
?水平集多模型算法：搜索運(yùn)算,，獲取**圖像分割效果,，適應(yīng)培養(yǎng)基背景變換
?特定菌落統(tǒng)計(jì)：根據(jù)菌落色澤、大小,、輪廓特征,，識別特定菌落
?反式統(tǒng)計(jì)：適合菌落類型極其復(fù)雜而培養(yǎng)基背景均勻
?高粘連菌統(tǒng)計(jì)：適合多重粘連菌的分割計(jì)算
?雜菌、雜質(zhì)剔除：根據(jù)形態(tài),、尺寸,、顏色的區(qū)別，進(jìn)行自動雜菌,、雜質(zhì)剔除
?螺旋菌落統(tǒng)計(jì)：根據(jù)FDA標(biāo)準(zhǔn)自動計(jì)數(shù)螺旋平板,，支持指數(shù)模式、緩慢指數(shù)模式,、均一模式,、比例模式、草坪模式等,。兼容美國SBI,、西班牙IUL螺旋接種儀。
4.網(wǎng)格濾膜與3M測試片
?黑色實(shí)線網(wǎng)格一鍵統(tǒng)計(jì)
?3M細(xì)菌總數(shù)測試片,、3M金黃色葡萄球菌測試片：一鍵統(tǒng)計(jì)
?3M大腸菌群測試片,、3M大腸桿菌/大腸菌群快速測試片：一鍵統(tǒng)計(jì)+人工選擇
5.典型菌篩選
?單色分類統(tǒng)計(jì)：根據(jù)顏色精度、擴(kuò)散度和菌落大小,、輪廓特征,，篩選特定菌落
?多色自動聚類：根據(jù)顏色聚類精度，自動區(qū)分24種不同顏色的菌落
?指定多色篩選：一次篩選1-8種指定顏色菌落
?透明圈特性分析：適用于抑菌圈,、水解圈,、變色圈、溶鈣圈,、溶血圈,、排油圈、溶磷圈分析
?雙色圈自動篩選
6.菌落特征描述
?細(xì)菌,、酵母：顏色,、大小,、形狀、表面形態(tài),、邊緣,、光澤、透明度等特征,，智能描述和排序
?霉菌,、放線菌：正面顏色、反面顏色,、大小,、表面形態(tài)、邊緣,、質(zhì)地等特征,，智能描述和排序
7.微生物限度分析工具
?培養(yǎng)基適用性檢查
?控制菌檢查-菌落形態(tài)
8.專項(xiàng)分析
?防霉檢測：定量分析防霉等級
?多區(qū)域串聯(lián)統(tǒng)計(jì)：適合培養(yǎng)基背景不均勻的復(fù)雜菌落
?多區(qū)域并聯(lián)統(tǒng)計(jì)：適合多孔板、OPKA,、SBA分析
9.高級工具
?網(wǎng)格清除：消除濾膜網(wǎng)格背景干擾
?人工計(jì)數(shù)修正：添加或刪除菌落
?排除污染區(qū)域：鼠標(biāo)勾勒任意污染區(qū)域,，自動剔除污染區(qū)域的菌落數(shù)
?背景文字清除：自動消除記號筆干擾
?人工粘連分割：手動分割多重粘連菌落
?參數(shù)自動換算：培養(yǎng)皿直徑、樣本稀釋度輸入,，實(shí)現(xiàn)自動換算
?文字,、圖形標(biāo)注：各類繪圖工具和中英文文字嵌入
10.標(biāo)定與測量
?儀器標(biāo)定：儀器自帶標(biāo)定、人工修正標(biāo)定
?一鍵式快速測量：一鍵測定大菌落,，適合真菌,、放線菌的單菌落分析
?全皿自動測量：全皿菌落的等效直徑、面積,、長短徑,、周長、圓度分析
?多向標(biāo)尺測量,、手動精確測量：長度,、角度、弧度,、面積,、弧線、任意曲線
11.圖像處理
?圖像調(diào)節(jié)：灰度圖,、負(fù)相圖轉(zhuǎn)換,；亮度、對比度,、飽和度調(diào)節(jié),；RGB調(diào)節(jié)
?圖像增強(qiáng)：銳化、自適應(yīng)增強(qiáng)
?圖像濾波：中值濾波、高通濾波,、高斯濾波,、低通濾波、隊(duì)列濾波,、高通高斯
?邊緣檢測：Sobel算子,、Robert算子、Laplace算子,、垂直檢測,、水平檢測
?形態(tài)學(xué)運(yùn)算：腐蝕、膨脹,、開運(yùn)算、閉運(yùn)算
四,、數(shù)據(jù)安全與管理
1.“系統(tǒng),、數(shù)據(jù)、操作,、復(fù)核”四重系統(tǒng)架構(gòu),，分設(shè)職能與權(quán)限，確保數(shù)據(jù)信息的安全,、完整和真實(shí)
?系統(tǒng)管理員（**層）：負(fù)責(zé)創(chuàng)建,、管理所有操作員與審核員的賬戶和登入密碼。確保操作員與操作員之間,、操作員與審核員之間的賬戶隔離與數(shù)據(jù)隔離,。
?數(shù)據(jù)管理員（副高層）：負(fù)責(zé)全部測試數(shù)據(jù)的檔案管理、以及計(jì)算機(jī)的數(shù)據(jù)庫管理,。封存所有審核通過的測試報(bào)告或?qū)⒃紙D片,、測試數(shù)據(jù)備份、導(dǎo)出,，保證了數(shù)據(jù)的完整性,、安全性。
?操作員：負(fù)責(zé)培養(yǎng)皿菌落的測試,、自檢,、修正、形成電子報(bào)告,、遞交審核,、對審核通過后的文件進(jìn)行報(bào)告打印。
?復(fù)核員：負(fù)責(zé)對操作員遞交的測試報(bào)告進(jìn)行審核,。核查數(shù)據(jù)輸入與處理過程,，但無權(quán)修改；對存疑報(bào)告作“審核退回”處理，要求操作員重新測試,；對“審核通過”的報(bào)告將**性存檔,，無論審核員還是操作員都無權(quán)再刪除，以確保數(shù)據(jù)的原始性和真實(shí)性,。
2.數(shù)據(jù)存儲與導(dǎo)出
?以電子數(shù)據(jù)為主,，記錄：樣本來源、編號,、稀釋度,、平皿圖片、識別效果,、計(jì)數(shù)值,、所用統(tǒng)計(jì)工具、參數(shù)設(shè)置,、修正情況,，確保記錄信息完整。
?滿足質(zhì)量審計(jì),，存儲的電子數(shù)據(jù)能以PDF或Excell格式打印輸出
3.水印簽章技術(shù),、防篡改技術(shù)、測試流程智能重構(gòu)技術(shù),，實(shí)現(xiàn)有效的審計(jì)追蹤
?防篡改技術(shù)
1)采用多用戶登入管理,，所有操作員、審核員的名字,，被系統(tǒng)自動記錄在操作流程和測試報(bào)告中,；所有操作日期、審核日期,，由計(jì)算機(jī)自動生成,，避免錯(cuò)填或偽造。
2)全部操作流程,，包括：菌落圖片,、培養(yǎng)皿尺寸、樣本稀釋度,、統(tǒng)計(jì)工具,、所用參數(shù)、測試所得的菌落總數(shù),、自檢修正后的菌落總數(shù)等,，由計(jì)算機(jī)自動記錄在數(shù)據(jù)庫中，操作員無法進(jìn)行改動,，為后續(xù)審計(jì)提供全部真實(shí)數(shù)據(jù),。
?水印簽章技術(shù)
“審核通過”的測試報(bào)告會自動生成操作員和審核員的賬戶電子簽名,，并在報(bào)告上加印防偽的“審核通過”水印簽章。
?測試流程的智能重構(gòu)技術(shù)
1)“復(fù)核員”打開“等待審核”的測試記錄,，計(jì)算機(jī)自動復(fù)原操作員的全部流程和測試環(huán)境,，包括：當(dāng)時(shí)所測的培養(yǎng)皿圖片、測試結(jié)果,、培養(yǎng)皿尺寸,、樣本稀釋度、采用的統(tǒng)計(jì)工具及所用參數(shù),、測試所得的菌落總數(shù),、修正情況……
2)通過測試環(huán)境和測試流程的重現(xiàn)，復(fù)核員可以追溯操作員的全部操作,，復(fù)核測試結(jié)果的準(zhǔn)確性,，達(dá)到審計(jì)追蹤目的。
五,、抑菌圈分析模塊
1.Szone 抑菌圈多模式測量技術(shù)
?自動檢測：基于抑菌圈輪廓的精確邊緣檢測,，適合邊緣清晰、圓形抑菌圈
?擬圓逼近：基于抑菌圈輪廓的圓形擬合逼近,，適合邊緣破裂、非標(biāo)準(zhǔn)圓形抑菌圈
?人工檢測：鼠標(biāo)點(diǎn)擊抑菌圈邊緣上三點(diǎn)成圓,，適合邊緣模糊的抑菌圈
2.抗生素效價(jià)測定
?一劑量法效價(jià)檢測：適合美國藥典
?二劑量法,、三劑量法及合并計(jì)算：適合中國藥典2020版
?重復(fù)性自檢：相對誤差≤0.01%、重復(fù)測量精度 ≤0.002mm
?均勻性自檢：相對誤差≤0.05%
?臺間測量差異≤0.2%
3.舒巴坦敏感β-內(nèi)酰胺酶檢驗(yàn)
?純水驗(yàn)證：根據(jù)（A）,、（B）,、（D）產(chǎn)生抑菌圈，D-C≧3,， B-A≦3 ,，判定系統(tǒng)成立
?自動檢測三個(gè)平行樣本的（A）、（B）,、（C）,、（D）抑菌圈，并數(shù)據(jù)導(dǎo)入
?自動計(jì)算平行試驗(yàn)平均值,，智能判別結(jié)果的陰陽性,。
?無效報(bào)告自動預(yù)警
六、儀器規(guī)格與配置
?多譜超分辨菌落成像系統(tǒng)主機(jī)1臺
?菌落分析軟件,、自動抑菌圈測量軟件,、抗生素效價(jià)測定軟件、舒巴坦敏感β-內(nèi)酰胺酶檢驗(yàn)軟件
?高端一體電腦:：雙核四線程CPU/4G內(nèi)存/1T硬盤/23"高清屏,，Windows 10系統(tǒng)
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