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歐盟**的農(nóng)業(yè)生物科技公司——荷蘭KeyGene公司,是一家專(zhuān)注于提供基因型-表型分析和性狀及關(guān)聯(lián)基因挖掘服務(wù)的公司,。自從2011年由KeyGene公司和德國(guó)LemnaTec共同建立的歐洲植物表型平臺(tái)PhenoFab投入運(yùn)轉(zhuǎn)后,迅速積累了大量的基因型-表型測(cè)量和分析經(jīng)驗(yàn),,并取得了異常出色的結(jié)果,,從而導(dǎo)致PhenoFab一直處于滿(mǎn)負(fù)荷運(yùn)轉(zhuǎn)狀態(tài)。
基于大量的PhenoFab使用經(jīng)驗(yàn)和數(shù)據(jù)分析的基礎(chǔ),,KeyGene研發(fā)出了一款國(guó)際上*小的便攜式植物表型平臺(tái)KeyBox,。
考慮到KeyBox可能需要經(jīng)常帶到溫室、野外或其它地方進(jìn)行測(cè)量,因此它被設(shè)計(jì)成可快速拆卸,、打包的樣式,。將KeyBox打包后,,就成為一個(gè)拉桿箱,,方便運(yùn)輸和攜帶。
折疊前 折疊后
技術(shù)路線(xiàn)
操作軟件
KeyBox的工作軟件Pheno-suite由KeyGene公司強(qiáng)大的生物信息學(xué)和軟件團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā),,充分考慮在實(shí)際應(yīng)用的需求,,操作簡(jiǎn)單,功能強(qiáng)大,。
Pheno-suite的工作模塊包括:
l 基礎(chǔ)整合模塊,。內(nèi)置在軟件中,是軟件的基本組成部分,。
l 選配模塊,。功能強(qiáng)大,針對(duì)應(yīng)用的每個(gè)算法是一個(gè)模塊,,客戶(hù)可以根據(jù)需求選配,。
基礎(chǔ)整合模塊 | 功能強(qiáng)大的選配模塊 |
l 顏色校準(zhǔn) Color correction | l 種子萌發(fā)測(cè)量 Seed germination in tray l 葉片大小測(cè)量 Leaf size detection KeyGene在不斷的研究新算法,新模塊出來(lái)后可以付費(fèi)升級(jí),。 |
應(yīng)用實(shí)例
1,、下圖中,利用KeyBox測(cè)量了辣椒的像素大小和破損部位的像素大小,,這樣就得出了辣椒的破損程度,。
2、 下圖中,,利用KeyBox測(cè)量了甜瓜的像素大小、黑點(diǎn)的像素大小,,得出黑點(diǎn)的占比,。還測(cè)量了甜瓜的圓度,。
3、下圖中,,利用KeyBox測(cè)量了一個(gè)葉片的尺寸和形態(tài)參數(shù)。
4,、下圖中,,利用KeyBox測(cè)量了一個(gè)104孔的芽盤(pán)中,,種子的萌發(fā)情況,,精確識(shí)別萌發(fā)的種子和未萌發(fā)的種子,,計(jì)算出萌發(fā)率,。
5,、下圖中,利用KeyBox研究了擬南芥野生型和突變株對(duì)霉病的抗性,,精確計(jì)算出病變部位的像素大小,。
主要功能l對(duì)植物體進(jìn)行整株或器官(果實(shí),、種子、根系,、葉片,、幼苗等) 的表型成像 l 便攜可折疊式設(shè)計(jì),方便帶到溫室或野外使用 l 標(biāo)準(zhǔn)光照環(huán)境,,數(shù)據(jù)可重復(fù) l 經(jīng)驗(yàn)豐富的專(zhuān)家根據(jù)應(yīng)用經(jīng)驗(yàn)設(shè)計(jì)的軟件,,操作簡(jiǎn)單,解決農(nóng)業(yè)應(yīng)用中遇到的問(wèn)題 l 內(nèi)置顏色校正和讀取電子標(biāo)簽的程 l 可選一系列的功能程序模塊,,并不斷升級(jí)中 | 應(yīng)用領(lǐng)域l 表型性狀分析/挖掘,,基因型-表型關(guān)聯(lián) l 農(nóng)業(yè)育種 l 園藝學(xué)、農(nóng)業(yè)信息學(xué) l 果實(shí)品質(zhì)分析 l 植物病理研究 l 生物量分析 l 種子萌發(fā)研究 l 抗逆研究 |
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