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田間全天候,、全自動監(jiān)測植物表型,!
高通量田間植物表型平臺FieldScan是專為田間表型研究設計的高通量植物表型平臺,可在任何環(huán)境條件下全天候測量,。根據(jù)系統(tǒng)設計的大小,,一套系統(tǒng)每天可測量上萬株植物,,每小時通量可達5000株植物,,可實現(xiàn)對植物生長和蒸騰(結(jié)合稱重系統(tǒng))的精確測量,特別適合應用于抗旱或其他表型性狀的大規(guī)模篩選,。不僅可直接掃描種植在田間土壤的植物,,同時還可掃描盆栽植物。在采用盆栽植物培養(yǎng)時,,可根據(jù)壓力傳感器跟蹤每株植物的重量,,計算其蒸騰速率。
設計理念-在高通量與準確性之間平衡
在現(xiàn)代植物研究與育種中,,田間表型是表型組學*亟需發(fā)展的領域之一,,一直面臨著各種挑戰(zhàn)。例如從全日照到夜間,,溫度的巨大變化和降雨等外界環(huán)境不僅影響測量技術(shù),,同時對植物也可能產(chǎn)生很大的影響。因此,,對測量技術(shù)來講,,需要設定非常合理的信噪比以準確地獲取表型信息;同時也需要在有限的時間段里,,高通量地獲取植物的表型信息,;當然對環(huán)境因子的同步監(jiān)測也十分必要。
在開發(fā)FieldScan時,我們的目標是提供一套可在任何環(huán)境下使用,;每天可進行多次掃描,;同時可剔除低質(zhì)量數(shù)據(jù)的田間表型獲取系統(tǒng)。如果側(cè)重通量和靈活性,,我們可以在田間使用拖拉機或UAV等移動設備,。但為了獲得毫米級的高精度測量,我們決定不再使用這些傳統(tǒng)移動設備,,而高精度的測量僅適用于固定式的系統(tǒng),。為此我們需要開發(fā)一套能同時滿足高精度和高通量的移動平臺。 FieldScan的設計,,采用移動式激光3D植物表型平臺 PlantEye作為核心,,并集成了其它多種傳感器。PlantEye用于獲取植物生長情況,。通過3D的頂部成像,,不僅能獲得葉面積、葉傾角,、冠層等參數(shù),,同時還能得到相對于其他技術(shù)更高的精度和通量。當然在需要時,,也可以集成其他傳感器,。在任何光照情況下,F(xiàn)ieldScan都能在不影響植物本身生長的情況下,,每天能對上萬株植物(取決于系統(tǒng)大?。┻M行10次重復測量,為用戶提供有價值的數(shù)據(jù),,方便了解植物在田間的生長情況,。
技術(shù)原理
同時集成氣象等其他因子傳感器,對植物生長環(huán)境進行同步測量
應用領域
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主要功能
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測量結(jié)果示例
應用實例:國際熱帶半干旱地區(qū)作物研究所(ICRISAT)
共集成了8臺PlantEye,每小時可以對2000-3000株植物進行表型分析,,一天的通量可以達到12000株,。該系統(tǒng)將精準灌溉、表型分析,、環(huán)境氣象等參數(shù)集成到一起,,由PhenoSpex的軟件系統(tǒng)進行全方位自動控制。
植株高度和分辨率
對PlantEye傳感器而言,,其測量的植株高度范圍很廣,,但是對于不同高度的植株需要做一些校正。植株越小,,分辨率越高,;植株越大,分辨率越低,。例如測量高度在0-30 cm的植株,,分辨率為0.2 mm,;測量高度在0-70 cm的植株,,分辨率為0.4 mm;測量高度在0-120 cm的植株,,分辨率為1 mm,。更高的植株也可以測量,只是分辨率稍有下降,。
軟件系統(tǒng)
測量結(jié)果舉例
獲獎
核心傳感器PlantEye系統(tǒng)榮獲如下獎項:
代表用戶
國際上很多的客戶與PhenoSpex公司簽有保密協(xié)議,,不允許后者公開客戶信息。這里僅僅列出了很少的一部分允許公開的用戶信息,。
國際熱帶半干旱地區(qū)作物研究所(ICRISAT),,用于珍珠粟(pearl millet)、高粱,、花生,、鷹嘴豆等的超高通量表型測量,,進行抗旱研究。
Jülich研究中心(Research Center Jülich),,歐洲**的科研機構(gòu)之一,,主要做甜菜和其它作物的表型研究。
瓦赫寧根大學,,全球***的農(nóng)業(yè)大學之一,,主要用于甜椒、紅掌等的早期脅迫監(jiān)測,。
世界**的特種肥料制造商Everris公司,,用于緩釋肥料的研發(fā)和作物管理。
德國Compo公司 (肥料公司) ,,用于協(xié)助作物提高抗旱性和抗鹽性的肥料篩選,。
波恩大學,用于田間小麥和大麥的高通量表型測量,。
LVG Heidelberg(海德堡州立園藝研究院),,用于園藝植物生長調(diào)節(jié)物質(zhì)的篩選。
奧胡斯大學(University Aarhus),,丹麥排名第二的大學,,用于菊花、小麥和歐洲油菜(Brassica napus)的表型測量,。
園藝領域
在園藝領域,,通過調(diào)節(jié)施肥、生長調(diào)節(jié)物質(zhì),、環(huán)境控制等方法可以改進,、優(yōu)化植物生長和作物管理。植物表型平臺PlantEye和管理軟件DocTool的結(jié)合使用有效優(yōu)化作物管理,,降低風險,。下面列出的這些用戶,采用這套方案大大降低了資源和成本的消耗,,顯著提高了產(chǎn)量,。
德國Blumen Rieke公司
德國Koster公司
其它不允許公開的用戶……
主要技術(shù)參數(shù)
通量:5000株/小時
集成傳感器:PlantEye,,溫濕度傳感器,, 光合有效輻射傳感器,風速風向傳感器,,雨量傳感器,, 負壓傳感器 (用于計算蒸騰,僅限盆栽)
測量的植物高度和分辨率:高度0-1500 mm,,分辨率0.2-1.0 mm,;其它植物高度可定制
傳感器到植物的距離:*小350-650 mm,**1100-2200 mm
掃描波長:700-1100 mm
測量速率:每秒50個XZ輪廓圖
信號接口:IN/OUT觸發(fā)信號接口
觸發(fā)選擇:感應開關(guān),,RFID,,光學二維碼,外部信號(如定位系統(tǒng)),,其它選擇可定制
測量參數(shù):高度(平均高度和**點),、獨立葉面積、總?cè)~面積(冠層面積),、投影葉面積,、蓋度、植物數(shù)目,、葉片數(shù)目,、葉片傾斜角PHI(Φ)、葉片方位角THETA(θ),、蓮座狀植物(rosette plants)的直徑,、植物體積、蒸騰速率,、溫度,、濕度、風速風向,、雨量,、光合有效輻射等
數(shù)據(jù)下載:允許下載3D點陣云圖(原始數(shù)據(jù))、植物生長數(shù)據(jù)和高度柱狀圖等,。
數(shù)據(jù)傳輸:通過Wifi無線傳輸
數(shù)據(jù)壓縮:自動壓縮
遠程訪問:支持通過>遠程訪問(ssh協(xié)議)
工作溫度:0-50℃
工作濕度:<90% RH
供電:12 VDC,、24 VDC,、230 VAC均可
激光安全等級:1M
光環(huán)境:耐受全日照輻射
防護等級:IP67
數(shù)據(jù)庫:PostgreSQL數(shù)據(jù)庫
PSX低通量方案:準系統(tǒng)電腦(Barebone computer)
PSX超供通量服務器方案:1U Intel Dual-CPU服務器(8 cores x 1GHz),, 8 GB;3 x 2000 GB硬盤,;RAID 5控制器,;1.5 TB磁帶驅(qū)動器
HortControl數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)
工作界面:通過瀏覽器登錄工作
軟件界面:提供不同界面用于數(shù)據(jù)自動導入,用于集成導入其它環(huán)境或植物傳感器的數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)下載:允許下載數(shù)據(jù)(ASCI)進行進一步分析,,允許導入/導出數(shù)據(jù)庫
檔案功能:具備檔案錄入,、顯示,,作物管理、實驗管理功能
統(tǒng)計功能:數(shù)據(jù)平均值和偏差值的統(tǒng)計分析
上載功能:能夠上載高通量平臺的實驗設置信息
報警功能:數(shù)據(jù)異常時報警
2D Mapping功能:對不同生長區(qū)域進行2D Mapping,,用于定量分析
暫無數(shù)據(jù),!