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田間全天候、全自動監(jiān)測植物表型,!
高通量田間植物表型平臺FieldScan是專為田間表型研究設(shè)計的高通量植物表型平臺,,可在任何環(huán)境條件下全天候測量。根據(jù)系統(tǒng)設(shè)計的大小,,一套系統(tǒng)每天可測量上萬株植物,,每小時通量可達(dá)5000株植物,可實現(xiàn)對植物生長和蒸騰(結(jié)合稱重系統(tǒng))的精確測量,,特別適合應(yīng)用于抗旱或其他表型性狀的大規(guī)模篩選,。不僅可直接掃描種植在田間土壤的植物,同時還可掃描盆栽植物,。在采用盆栽植物培養(yǎng)時,,可根據(jù)壓力傳感器跟蹤每株植物的重量,計算其蒸騰速率,。
設(shè)計理念-在高通量與準(zhǔn)確性之間平衡
在現(xiàn)代植物研究與育種中,,田間表型是表型組學(xué)*亟需發(fā)展的領(lǐng)域之一,一直面臨著各種挑戰(zhàn),。例如從全日照到夜間,,溫度的巨大變化和降雨等外界環(huán)境不僅影響測量技術(shù),同時對植物也可能產(chǎn)生很大的影響,。因此,,對測量技術(shù)來講,需要設(shè)定非常合理的信噪比以準(zhǔn)確地獲取表型信息,;同時也需要在有限的時間段里,,高通量地獲取植物的表型信息,;當(dāng)然對環(huán)境因子的同步監(jiān)測也十分必要。
在開發(fā)FieldScan時,,我們的目標(biāo)是提供一套可在任何環(huán)境下使用,;每天可進(jìn)行多次掃描;同時可剔除低質(zhì)量數(shù)據(jù)的田間表型獲取系統(tǒng),。如果側(cè)重通量和靈活性,,我們可以在田間使用拖拉機(jī)或UAV等移動設(shè)備。但為了獲得毫米級的高精度測量,,我們決定不再使用這些傳統(tǒng)移動設(shè)備,,而高精度的測量僅適用于固定式的系統(tǒng)。為此我們需要開發(fā)一套能同時滿足高精度和高通量的移動平臺,。 FieldScan的設(shè)計,,采用移動式激光3D植物表型平臺 PlantEye作為核心,并集成了其它多種傳感器,。PlantEye用于獲取植物生長情況,。通過3D的頂部成像,不僅能獲得葉面積,、葉傾角,、冠層等參數(shù),同時還能得到相對于其他技術(shù)更高的精度和通量,。當(dāng)然在需要時,,也可以集成其他傳感器。在任何光照情況下,,F(xiàn)ieldScan都能在不影響植物本身生長的情況下,,每天能對上萬株植物(取決于系統(tǒng)大小)進(jìn)行10次重復(fù)測量,,為用戶提供有價值的數(shù)據(jù),,方便了解植物在田間的生長情況。
技術(shù)原理
同時集成氣象等其他因子傳感器,,對植物生長環(huán)境進(jìn)行同步測量
應(yīng)用領(lǐng)域
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主要功能
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測量結(jié)果示例
應(yīng)用實例:國際熱帶半干旱地區(qū)作物研究所(ICRISAT)
共集成了8臺PlantEye,,每小時可以對2000-3000株植物進(jìn)行表型分析,一天的通量可以達(dá)到12000株,。該系統(tǒng)將精準(zhǔn)灌溉,、表型分析、環(huán)境氣象等參數(shù)集成到一起,,由PhenoSpex的軟件系統(tǒng)進(jìn)行全方位自動控制,。
植株高度和分辨率
對PlantEye傳感器而言,其測量的植株高度范圍很廣,,但是對于不同高度的植株需要做一些校正,。植株越小,分辨率越高,;植株越大,,分辨率越低。例如測量高度在0-30 cm的植株,,分辨率為0.2 mm,;測量高度在0-70 cm的植株,分辨率為0.4 mm,;測量高度在0-120 cm的植株,,分辨率為1 mm。更高的植株也可以測量,,只是分辨率稍有下降,。
軟件系統(tǒng)
測量結(jié)果舉例
獲獎
核心傳感器PlantEye系統(tǒng)榮獲如下獎項:
代表用戶
國際上很多的客戶與PhenoSpex公司簽有保密協(xié)議,不允許后者公開客戶信息,。這里僅僅列出了很少的一部分允許公開的用戶信息,。
國際熱帶半干旱地區(qū)作物研究所(ICRISAT),用于珍珠粟(pearl millet)、高粱,、花生,、鷹嘴豆等的超高通量表型測量,進(jìn)行抗旱研究,。
Jülich研究中心(Research Center Jülich),,歐洲**的科研機(jī)構(gòu)之一,主要做甜菜和其它作物的表型研究,。
瓦赫寧根大學(xué),,全球***的農(nóng)業(yè)大學(xué)之一,主要用于甜椒,、紅掌等的早期脅迫監(jiān)測,。
世界**的特種肥料制造商Everris公司,用于緩釋肥料的研發(fā)和作物管理,。
德國Compo公司 (肥料公司) ,,用于協(xié)助作物提高抗旱性和抗鹽性的肥料篩選。
波恩大學(xué),,用于田間小麥和大麥的高通量表型測量,。
LVG Heidelberg(海德堡州立園藝研究院),用于園藝植物生長調(diào)節(jié)物質(zhì)的篩選,。
奧胡斯大學(xué)(University Aarhus),,丹麥排名第二的大學(xué),用于菊花,、小麥和歐洲油菜(Brassica napus)的表型測量,。
園藝領(lǐng)域
在園藝領(lǐng)域,通過調(diào)節(jié)施肥,、生長調(diào)節(jié)物質(zhì),、環(huán)境控制等方法可以改進(jìn)、優(yōu)化植物生長和作物管理,。植物表型平臺PlantEye和管理軟件DocTool的結(jié)合使用有效優(yōu)化作物管理,,降低風(fēng)險。下面列出的這些用戶,,采用這套方案大大降低了資源和成本的消耗,,顯著提高了產(chǎn)量。
德國Blumen Rieke公司
德國Koster公司
其它不允許公開的用戶……
主要技術(shù)參數(shù)
通量:5000株/小時
集成傳感器:PlantEye,,溫濕度傳感器, 光合有效輻射傳感器,,風(fēng)速風(fēng)向傳感器,,雨量傳感器, 負(fù)壓傳感器 (用于計算蒸騰,,僅限盆栽)
測量的植物高度和分辨率:高度0-1500 mm,,分辨率0.2-1.0 mm;其它植物高度可定制
傳感器到植物的距離:*小350-650 mm,,**1100-2200 mm
掃描波長:700-1100 mm
測量速率:每秒50個XZ輪廓圖
信號接口:IN/OUT觸發(fā)信號接口
觸發(fā)選擇:感應(yīng)開關(guān),,RFID,光學(xué)二維碼,,外部信號(如定位系統(tǒng)),,其它選擇可定制
測量參數(shù):高度(平均高度和**點)、獨立葉面積,、總?cè)~面積(冠層面積),、投影葉面積、蓋度,、植物數(shù)目、葉片數(shù)目,、葉片傾斜角PHI(Φ),、葉片方位角THETA(θ)、蓮座狀植物(rosette plants)的直徑,、植物體積,、蒸騰速率、溫度,、濕度,、風(fēng)速風(fēng)向、雨量,、光合有效輻射等
數(shù)據(jù)下載:允許下載3D點陣云圖(原始數(shù)據(jù)),、植物生長數(shù)據(jù)和高度柱狀圖等。
數(shù)據(jù)傳輸:通過Wifi無線傳輸
數(shù)據(jù)壓縮:自動壓縮
遠(yuǎn)程訪問:支持通過>遠(yuǎn)程訪問(ssh協(xié)議)
工作溫度:0-50℃
工作濕度:<90% RH
供電:12 VDC,、24 VDC,、230 VAC均可
激光安全等級:1M
光環(huán)境:耐受全日照輻射
防護(hù)等級:IP67
數(shù)據(jù)庫:PostgreSQL數(shù)據(jù)庫
PSX低通量方案:準(zhǔn)系統(tǒng)電腦(Barebone computer)
PSX超供通量服務(wù)器方案:1U Intel Dual-CPU服務(wù)器(8 cores x 1GHz), 8 GB,;3 x 2000 GB硬盤,;RAID 5控制器,;1.5 TB磁帶驅(qū)動器
HortControl數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)
工作界面:通過瀏覽器登錄工作
軟件界面:提供不同界面用于數(shù)據(jù)自動導(dǎo)入,用于集成導(dǎo)入其它環(huán)境或植物傳感器的數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)下載:允許下載數(shù)據(jù)(ASCI)進(jìn)行進(jìn)一步分析,,允許導(dǎo)入/導(dǎo)出數(shù)據(jù)庫
檔案功能:具備檔案錄入,、顯示,作物管理,、實驗管理功能
統(tǒng)計功能:數(shù)據(jù)平均值和偏差值的統(tǒng)計分析
上載功能:能夠上載高通量平臺的實驗設(shè)置信息
報警功能:數(shù)據(jù)異常時報警
2D Mapping功能:對不同生長區(qū)域進(jìn)行2D Mapping,,用于定量分析
暫無數(shù)據(jù)!