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GenePix 4100A微陣列基因芯片掃描儀
無需在煩躁情緒中繼續(xù)等待中心實驗室或相鄰實驗室正在工作中的基因芯片掃描儀?,F(xiàn)在可以以更優(yōu)惠價格馬上獲得一款高性能的微陣列基因芯片掃描儀。Molecular Devices公司推出的GenePix®4100A微陣列基因芯片掃描儀具有高端基因芯片掃描儀所有的特質(zhì):如超高靈敏性,,可靠性和易操作性,。實惠的價格和緊湊設(shè)計使得它更佳適合小實驗室中使用,。GenePix4100A基因芯片掃描儀支持用戶在5-100μm范圍內(nèi)隨意調(diào)節(jié)其分辨率來獲取數(shù)據(jù)??舍槍唧w實驗的需求優(yōu)化圖像分辨率和文件的大小,。GenePix4100A基因芯片掃描儀具有自動調(diào)節(jié)PMT增益的功能,,可簡便、快速對信號強度和通道的平衡進行優(yōu)化,。
主要特點:
1,,一款簡潔、易用,、高性價比掃描儀
2,,出眾的成像精度
3,出色的重復性
4,,可靈活的支持各種熒光染料檢測
5,,可整合GenePix Pro圖像分析軟件
儀器優(yōu)勢:
1,,可自主研究不同染料:GenePix® 4100A 微陣列掃描儀可支持多種不同的熒光染料分子,, 其光學設(shè)計集成了用戶可選的 6 種不同的發(fā)射濾光片,。
2,結(jié)果可靠:定期使用隨機附帶的校準玻片組來對微陣列掃描儀進行校正,, 以確保長期使用時光電倍增管 (PMT) 的重復性能。此外,, 在掃描過程中會動態(tài)監(jiān)測激光功率變化, 以確保獲得穩(wěn)定的信號輸出,, 同時硬件診斷報告將持續(xù)的對掃描儀性能狀況進行記錄,。利用這些功能, 可以立刻識別并糾正錯誤信息,。
3,優(yōu)化動態(tài)設(shè)置:GenePixPro 自動繪制像素強度分布的柱狀圖,。根據(jù)掃描進度動態(tài)更新圖像和柱狀圖;并可在掃描時優(yōu)化掃描儀設(shè)置,。
4,,調(diào)整應用分辨率:使用 40 微米預覽掃描可定位微陣列并優(yōu)化硬件設(shè)置, 而數(shù)據(jù)掃描可以用于準確定量,。GenePix 4100A 微陣列基因芯片掃描儀支持 5 至 100 微米分辨率的樣品,, 滿足您的任何要求,。
5,,較高的信噪比:本檢測系統(tǒng)采用低噪聲,、高靈敏的 PMT 將光子轉(zhuǎn)變成電信號,, 然后使用優(yōu)質(zhì)的超低噪聲數(shù)模轉(zhuǎn)換器技術(shù)將其數(shù)字化。調(diào)節(jié)PMT增益和平均多線掃描,, 以在低信號樣品檢測上獲得更高的信噪比 (SNR),。
6,樣本追蹤:GenePix® Pro 采集和分析軟件自動讀取預覽掃描,、數(shù)據(jù)掃描和保存圖像的條形碼, 并將導出獲得的數(shù)據(jù),。
動態(tài)監(jiān)測激光光源
GenePix4100A基因芯片掃描儀光源強度可針對每個像素點進行相應變化,實時的動態(tài)監(jiān)測,,確保每個像素點均可獲得穩(wěn)定的,、持續(xù)的信號。采用先進的激光器,,配合了獨特的強度校正系統(tǒng),,保證在圖像中的所有像素點具有相等的曝光效率。內(nèi)置所有激光器均具有自動校正功能,,可以動態(tài)的監(jiān)測激光器微小的波動,大大提高了信號噪聲比,。所有這些功能特征保證獲取的數(shù)據(jù)具有高度重復性,,避免了再一次費時、費力的重復相應實驗,。
8位濾光輪可大大提高熒光染料檢測的靈活性
GenePix4100A基因芯片掃描儀光路中設(shè)計有一個8位的發(fā)射濾光片轉(zhuǎn)輪(如圖一),,標配有紅色和綠色濾光片。根據(jù)需要還可以再裝6個濾光片,,提高了靈活性,,以便于滿足其它多種熒光染料的檢測。作為質(zhì)控程序的一部分,我們通過使用濾光片轉(zhuǎn)輪中的空位置或中性密度濾光片,,也可以用掃描儀的635nm進行反射成像,,允許用戶檢查未標記的DNA陣列點形態(tài)上變化。
采用非共聚焦光路
采用非共聚焦光路的GenePix 4100A基因芯片掃描儀可用于微陣列芯片成像分析,。其它類型基因芯片掃描儀大多利用共聚焦技術(shù)對厚樣品的進行薄切片分層式成像,,如組織樣本,證實其并不適合進行微陣列掃描成像,。
微陣列芯片上大多數(shù)背景信號來源于非特異性的雜交反應,,它們與樣品位于同樣的焦平面上(如圖二)。此外,,絕大多數(shù)微陣列基因芯片表面為非均一平面,由于共聚焦成像系統(tǒng)具有非常窄的景深,,會受到各種不同基質(zhì)載體的焦平面的變化而產(chǎn)生波動,。GenePix基因芯片掃描儀具有大景深檢測能力,可以在各種微陣列芯片表面收集更多的光學信號,,同時也能夠避免附近雜散光的干擾。
軟件和硬件的高度結(jié)合
所有GenePix4100A基因芯片掃描儀家族成員在設(shè)計之初就被要求能與GenePix Pro微陣列分析軟件**整合在一起,。(如圖三)掃描儀和軟件之間這種無縫式的通信方式確保了其科高效的獲取和分析相應實驗數(shù)據(jù),也能夠?qū)崟r檢測掃描儀工作狀態(tài),??蛇x的Acuity微陣列信息分析軟件,,具有數(shù)據(jù)庫儲存能力,、群集算法,、高級統(tǒng)計學能力和可視化界面。
儀器應用:
1,,基因組學:針對基因組序列本身,,微陣列可用于識別全新基因,、轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點、DNA 拷貝數(shù)變化,、基礎(chǔ)基因序列變異(如新發(fā)現(xiàn)病原體菌株或人類致病基因的復雜突變)。
2,轉(zhuǎn)錄組學: 使用高密度微陣列芯片,, 給復雜疾病轉(zhuǎn)錄水平的研究檢測帶來影響,。通過目前**微陣列檢測技術(shù)的發(fā)展, 現(xiàn)在可以總體上定量分析轉(zhuǎn)錄水平,, 并將這些數(shù)據(jù)與疾病相關(guān)信息進行整合?;谖㈥嚵械霓D(zhuǎn)錄組學可利用受影響和未受影響的個體繪制出某一疾病的關(guān)鍵基因區(qū)域,, 然后通過識別關(guān)鍵區(qū)域中的差異表達基因來確定致病基因,。
3,蛋白質(zhì)組:盡管尚未實現(xiàn)全蛋白質(zhì)組分析,, 微陣列芯片仍然促進了蛋白質(zhì)組學領(lǐng)域取得長足進展。蛋白質(zhì)組學展現(xiàn)出廣泛動態(tài)復雜性,;哺乳動物中不同蛋白質(zhì)的數(shù)量一定超過基因數(shù)量,, 因而需要合適的技術(shù)以進行相應分析。GenePix 微陣列基因芯片掃描儀具有很高的靈活性,, 尤其是整合GenePix SL50 自動芯片裝入系統(tǒng)后,, 可大大提高檢測通量, 可為研究人員提供優(yōu)質(zhì)的工具,。
4,,表觀遺傳學:基因是承載著遺傳信息的基本單位, 但這些信息僅在由表觀基因組適當編碼時才產(chǎn)生影響,。DNA 甲基化模式是細胞類型特異性的,, 與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)相關(guān)。DNA 微陣列基因芯片可用于識別甲基化模式,, 而且 GenePix 微陣列基因芯片掃描儀自動化解決方案使研究人員能夠更快認識這些模式,。
5,新應用:微陣列研究的創(chuàng)造性和廣泛適用性是沒有限制的,。各種應用微陣列進行大批量的定量分析強調(diào)了這一點,。GenePix® 微陣列基因芯片掃描儀可提供較靈活的研究解決方案和更大的自由度。
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