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貝克曼庫爾特商貿(mào)（中國）有限公司
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目標區(qū)域捕獲測序技術(shù),，是根據(jù)已知特定基因組區(qū)域序列設(shè)計寡核苷酸探針，通過雜交將目標區(qū)域捕獲富集進行二代測序,。其針對目標區(qū)域深度測序,，增加了檢查靈敏度和準確性。既滿足研究需求,，又降低測序成本,，在科研、臨床中均備受關(guān)注。
液體處理專家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動化捕獲測序方案,，幫助您實現(xiàn)自動化,、標準化的捕獲測序。 由自動化工作站進行基因捕獲,，可以減少手工操作時間,，提高工作效率，增加結(jié)果的重復(fù)性和均一性,。 Biomek工作站可實現(xiàn)從核酸提取,，文庫構(gòu)建，定量混樣到捕獲的整體實驗流程,。
Figure 1. 捕獲測序文庫構(gòu)建自動化流程
由Biomek成功自動化的雜交捕獲試劑盒：
- Agilent HaloPlex? Target Enrichment - Ion Torrent
- Agilent SureSelect XT?
- Epicentre ScriptSeq? Complete Gold Low Input
- Illumina Nextera? Rapid Capture
- Illumina TruSeq? Exome
- Illumina TruSeq? Rapid Exome
- Illumina TruSight? Cancer
- Illumina TruSight? Tumor 15
- Illumina TruSight? Tumor 170
- IDT xGen? Exome Research Panel
- NEB NEBNext Direct? Cancer HotSpot Panel
- Roche Nimblegen SeqCap EZ? for Illumina NGS
Biomek自動化捕獲測序數(shù)據(jù)展示
Figure 2. IDT xGen? Exome Research Panel試劑盒捕獲測序文庫制備,。
上圖： 片段分析，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標片段峰,；
下圖：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結(jié)果,。
Figure 3. IDT xGen?雜交捕獲試劑盒歷史手工數(shù)據(jù)vs.
Biomek i7自動化工作站完成數(shù)據(jù)。A. 平均中靶率,，B. 重復(fù)率,，C. 覆蓋度，D. GC偏移,。
Biomek向?qū)杰浖僮鹘缑?/span>
在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數(shù)量,，是否使用臺面整合的PCR儀，以及運行工作流程的哪個部分,。此外,，具備臺面自動校對功能，當(dāng)操作人員完成耗材擺放后,，工作站可根據(jù)攝像頭拍攝,，自動判定耗材擺放是否正確，對錯誤擺放位置進行提示,。避免由于人為擺放耗材錯誤,，導(dǎo)致設(shè)備碰撞或試劑、時間損失,。
Figure 4. 向?qū)杰浖僮?，IDT xGen? 雜交捕獲試劑盒方法選擇界面。
Biomek自動化捕獲測序——實踐速度與通量的飛躍
Figure 5. 完成 24/48/96個樣本的自動化IDT xGen?雜交捕獲測序文庫制備預(yù)估耗時,。
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