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DO MORE with LESS |用聲波玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞測序

貝克曼庫爾特生命科學(xué) 2020-07-31 | 閱讀：1401

單細(xì)胞測序技術(shù)起始核酸材料極少,，步驟比普通NGS繁雜,，實(shí)驗(yàn)周期更長，難度和風(fēng)險(xiǎn)也更大,。重現(xiàn)性和成功率是一大考驗(yàn),。單細(xì)胞測序方法眾多，除了商品化試劑盒,，許多研究人員也會針對自己關(guān)注的特征開發(fā)全新的技術(shù),。另一方面，開展腫瘤異質(zhì)性等針對細(xì)胞群體的研究越來越普遍,，這需要對大批量細(xì)胞進(jìn)行逐一的測序和解析,。如果按照試劑盒常量/rxn，手工完成每一個(gè)細(xì)胞的實(shí)驗(yàn),，勞力和成本都難以承受,。

Echo硬核的聲波移液技術(shù)技術(shù)，通過能量控制準(zhǔn)確的納升級液體轉(zhuǎn)移,，噴射液滴單位可以低至2.5 nL,。其非物理接觸、準(zhǔn)確小量移液,、高速度的特征,，決定了Echo非常適合解決單細(xì)胞測序中遇到的超高通量、技術(shù)靈活多變,、反應(yīng)scale-down成本控制,、交叉污染等問題。

非物理接觸

· 樣本完整性

· 無吸頭消耗

· 降低交叉污染風(fēng)險(xiǎn)

移液的靈活性

· 2.5 /25 nL 每滴

· 200-500 滴/秒

· 任意孔至任意孔移液

移液條件溫和

· DNA/RNA/蛋白等生物大分子

以結(jié)合SMART-Seq cDNA文庫制備及Nextera XT 測序文庫制備的單細(xì)胞RNA-seq實(shí)驗(yàn)為例,。SMART-Seq反應(yīng)體系（50 uL）可以由Echo縮小4,，5，8,，10,，16，20至32倍,，Nextera XT 試劑盒可縮小10倍（50 uL至5 ul）使用,。值得注意的是，SMART-seq cDNA文庫制備中，常量反應(yīng)總體積為50 ul, 縮小32倍后反應(yīng)總體積僅僅只有1.75 uL,，還不及一個(gè)常量反應(yīng)中逆轉(zhuǎn)錄酶使用量大,。借助Echo，一個(gè)96 rxn的試劑盒將具備完成3072 rxn的可能,。

Echo可以完成

● 微量化的單細(xì)胞基因組放大3

● 微量化的單細(xì)胞測序文庫制備

● 微量化的文庫濃度質(zhì)控

● 一步法文庫Normalization&Pooling

● Better together—— Echo plus Biomek自動化單細(xì)胞測序方案

基于Echo的單細(xì)胞文庫制備不受待測細(xì)胞數(shù)目的限制，支持各種試

Better together—— Echo plus Biomek自動化單細(xì)胞測序方案

基于Echo的單細(xì)胞文庫制備不受待測細(xì)胞數(shù)目的限制,，支持各種試劑盒的靈活組合和NGS建庫方法學(xué)DIY,。做你想做的，測你想測的,，提供scale-down的微量化反應(yīng)體系和scale-up的自由度,。

將Echo聲波移液工作站與Biomek i-系列自動化工作站結(jié)合，可實(shí)現(xiàn)更高自動化程度的單細(xì)胞測序?qū)嶒?yàn),。Echo完成文庫制備中涉及的微量化反應(yīng)體系構(gòu)建,，由Biomek自動化工作站配合實(shí)現(xiàn)文庫 Agencourt SPRIselect磁珠PCR clean-up和片段篩選。實(shí)驗(yàn)流中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)均可查可溯,，保證文庫信息安全可靠,。