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5月8日,， Memorial Sloan Kettering Cancer Center （MKSCC）的科學家在Nature Medicine雜志發(fā)表一篇重量級文章,，他們通過對上萬名晚期癌癥患者，300多種腫瘤進行了基因測序,，并同時收集這些腫瘤病人的臨床,、病理等各方面信息，并將這些信息公開在http://cbioportal.org/msk-impace網(wǎng)站上,，以便全世界的研究人員能共享這些數(shù)據(jù)與信息,。
MSK-IMPACT，一種新型的基因捕獲測序
此研究是基于MSK-IMPACT （Integrated Mutation Profiling of Actionable Cancer Targets）測序技術進行的,，這是一種更靈活和全面的新型癌癥測序技術,，不僅適合當前大部分腫瘤類型，而且還能夠檢測罕見的突變以及其他關鍵的遺傳變異,。MSK-IMPACT是以二代測序（NGS）為基礎,，并結(jié)合癌癥基因的研究，選擇了341個關鍵的“癌基因”,。研究人員通過對癌癥患者的這些“癌基因”區(qū)域測序,，可以檢測到相關蛋白編碼區(qū)突變、拷貝數(shù)突變,、啟動子突變和基因重排等基因突變,。
Biomek FXp自動化工作站助力MSK-IMPACT高質(zhì)量測序文庫
研究人員將獲得的50-250 ng DNA先使用Biomek FXp自動化工作站進行濃度均一化在55uL 的TE緩沖液中，然后使用Covaris進行片段化,。之后,，再在Biomek FXp上進行一系列的酶反應及純化，包括片段化,、末端修復,、加A堿基、接頭連接和PCR富集等（Kapa Biosystems）,，以獲得高質(zhì)量的測序文庫,。
共享數(shù)據(jù)開啟精準醫(yī)療新局面
此項研究打開了MSKCC在臨床測序領域的一個“高潮”，300多種腫瘤，上萬名癌癥患者測序突變數(shù)據(jù)庫的建立與數(shù)據(jù)共享更是一個新的里程碑,，讓測序數(shù)據(jù)不再只是堿基序列,，而是存在巨大潛力的寶藏，造福全人類,。
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