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*短的時(shí)間內(nèi)獲得答案,，智能化的工作流程，廣泛的測(cè)序應(yīng)用范圍

Illumina公司推出的MiSeq是目前**一臺(tái)在單個(gè)儀器上整合了擴(kuò)增,、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析的新一代測(cè)序儀,，每次運(yùn)行能產(chǎn)生超過1 Gb的數(shù)據(jù)，且占地面積僅為2平方英尺,。MiSeq有著革命性的流程和無可比擬的準(zhǔn)確性,，這讓它成為快速且經(jīng)濟(jì)高效的遺傳分析的理想平臺(tái)，適合廣泛的應(yīng)用,。同時(shí)根據(jù)Illumina的**消息,，今年9月份左右，MiSeq系統(tǒng)的測(cè)序通量將會(huì)升級(jí)至7G左右,。升級(jí)將通過兩個(gè)方面完成,，一個(gè)是cluster密度的增大,，升級(jí)后cluster密度將會(huì)增加至12-15million,，而pair-end讀取的reads數(shù)目將會(huì)增加至24-30million；另一方面是通過測(cè)序讀長(zhǎng)而提升通量,，屆時(shí)測(cè)序讀長(zhǎng)會(huì)達(dá)到2*250bp，同時(shí)測(cè)序速度也會(huì)有所提升。目前,，Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實(shí)現(xiàn)了單端測(cè)序300bp讀長(zhǎng),，Illumina目前內(nèi)部測(cè)序更是完成了2*400bp的pair-end測(cè)序,。而這些，都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的,。

MiSeq性能參數(shù)

工作流程

4大特性

1,、*短的實(shí)驗(yàn)周期：從樣品制備開始只需要8小時(shí)即可得到超過100M的高質(zhì)量測(cè)序結(jié)果。

2,、*便捷的樣品制備流程：只需50ngDNA模板，2小時(shí)的自動(dòng)化操作就可以完成全部樣品制備工作,。

3,、*精確的測(cè)序原理：MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺(tái)的邊合成邊測(cè)序的化學(xué)原理,，數(shù)千篇高質(zhì)量的國(guó)際期刊文章是對(duì)Illumina NGS平臺(tái)測(cè)序結(jié)果可信度*有力的證明,。

4,、*完整的整合功能：MiSeq可以獨(dú)立完成簇生成,，雙向測(cè)序及數(shù)據(jù)分析工作,，讓經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)室空間不再成為NGS研究的障礙,。

應(yīng)用范圍

1,、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

派森諾MiSeq測(cè)序平臺(tái)是基因組已測(cè)序物種的轉(zhuǎn)錄組分析**平臺(tái),。公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了包括斑馬魚在內(nèi)的多種植物,、動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析,。

2,、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測(cè)序

對(duì)16s rDNA的單V區(qū)(V3\V4)進(jìn)行高通量測(cè)序,，鑒定細(xì)菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)使用Illumina MiSeq測(cè)序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測(cè)序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對(duì)雞的腸道環(huán)境細(xì)菌進(jìn)行了鑒定,。

3,、Small RNA測(cè)序

1*35bp的讀長(zhǎng)**地配合了小RNA的測(cè)序長(zhǎng)度,，速度快,，靈敏度高,。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了鵝的小RNA測(cè)序和多種中草藥的小RNA測(cè)序,。

4,、重測(cè)序：

包括全基因組重測(cè)序,、簡(jiǎn)化基因組測(cè)序,、外顯子測(cè)序,。

Illumina MiSeq非常適用于對(duì)微生物基因組的重測(cè)序,，每次運(yùn)行即可完成一個(gè)微生物基因組測(cè)序,。2011年12月27日,，派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)利用MiSeq一次運(yùn)行同時(shí)完成了乳酸菌

（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測(cè)序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍,，比對(duì)至參考序列，基因組覆蓋率為100%,，同時(shí)檢測(cè)到了多種結(jié)構(gòu)變異,，包括插入,、缺失和SNP位點(diǎn)，并且檢測(cè)到了全部質(zhì)粒,。