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平行板納米通道中生物分子遷移的分子模擬

編號:NMJS03238

篇名:平行板納米通道中生物分子遷移的分子模擬

作者:劉坤,; 張曉玲,; 肖松文; 巴德純;

關鍵詞:分子模擬,; 納流控,; 蛋白質分子,; 離子,; 遷移特性;

機構: 東北大學機械工程與自動化學院,; 首都航天機械公司,;

摘要: 基于GROMACS程序包,建立了蛋白質分子和離子在平板型納米通道內的流動模型,對3.1 nm高的平行板納米通道內的遷移過程進行了分子模擬,并對均方根偏差分布、水分子密度分布,、離子濃度分布等模擬結果進行了討論.結果表明:水分子在壁面附近出現(xiàn)分層現(xiàn)象,并且形成致密層,密度達到2 500 kg/m3,在中間區(qū)域分布平穩(wěn);蛋白質分子在離子和電場作用下做翻轉和平移運動,沿著電場方向通過管道;通過比較通道表面帶電和不帶電兩種情況下的粒子分布,得出通道壁面對溶液中離子的靜電作用是出現(xiàn)"電荷倒置"現(xiàn)象的原因.

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