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Spillover vs. Spread：破解精準流式多色分析的斯芬克斯之謎

貝克曼庫爾特生命科學 2024-08-23 | 閱讀：1352

盡管不少同學與老師認為光譜流式無需像傳統(tǒng)流式那樣調節(jié)補償,，甚至可以使用光譜接近的熒光染料,，從而在流式多色方案設計上可以隨意搭配，然而,，在實際嘗試光譜流式細胞儀后,，這種誤解常常導致實驗結果不理想。即使在光譜流式中,，熒光染料的選擇和搭配仍然需要經過精心設計和優(yōu)化,，以避免信號干擾和數(shù)據(jù)解讀錯誤。因此,，合理設計多色實驗仍然是獲得準確可靠結果的關鍵所在,。

圖1：補償?shù)亩x：(a) 顯示了使用PE標記抗體染色的人外周血單個核細胞（PBMCs）未經補償（左圖）和補償后（右圖）的數(shù)據(jù)。為了去除630/30濾光片中的PE信號,，需要計算Y/X*100的比例,。補償后的數(shù)據(jù)展示了PE信號的擴散（spread）。(b) PE的發(fā)射譜圖中展示了在(a)圖中使用的兩個濾光片,。

無論采用哪種技術,，免疫分型實驗的成功都取決于對Spillover和Spread的正確理解和管理。這些概念對于實驗結果的精準性至關重要,。無論使用傳統(tǒng)流式還是光譜流式,，精心設計和優(yōu)化熒光染料組合，合理應對這些關鍵挑戰(zhàn),，仍然是獲得可靠實驗數(shù)據(jù)的關鍵步驟,。

首先，讓我們通過一個具體案例來深入理解Spread如何影響實驗結果的準確性,。

圖2：擴散（spread）現(xiàn)象的重要性：人類外周血單個核細胞（PBMCs）被標記了Alexa Fluor 647標記的CD45RA,，以及BV421、PE-CF594或PE-Cy5標記的CD4抗體,。藍色輪廓表示單色CD4染色細胞,，紅色輪廓顯示了組合染色。圖中顯示雙陽性群體在低擴散（spread）情況下能更好地與單陽性群體分離,，尤其是來自僅染色CD4的細胞,，這通過更高百分比得以顯示。這說明擴散（spread）在數(shù)據(jù)分析中的重要性,。

每種熒光染料的光譜都有可能部分重疊,，即使在解混（unmix）過程中也難以完全避免這種干擾,。如果不慎重選擇熒光染料組合，特別是光譜接近的染料,，可能會導致解混（unmix）后信號分離不完全,，進而影響實驗的準確性和可重復性。因此,，無論使用的是傳統(tǒng)流式還是光譜流式,，精心設計和優(yōu)化多色免疫分型方案，合理選擇熒光染料組合,，仍然是獲得可靠實驗結果的關鍵步驟,。

圖3：spread如何減弱信號的分離效果：在第一行（配色方案1），我們選擇了不會在APC和PerCP-eFluor 710檢測器中引起spread的熒光染料,。盡管在CD4軸上有輕微但明顯的分離（黑色箭頭所示）,，TCRγδ單陽性和TCRγδ/CD3雙陽性信號（紅色箭頭所示）的分離效果也相對良好。在第二行（配色方案2）,，我們使用了BV650（結合CD45）,，引入了APC檢測器中的spread，并消除了配色方案1中看到的分離（黑色箭頭）,。此外,，將結合CD3的熒光染料從BV605改為APC-R700后，在PerCP-eFluor 710檢測器中引起了spread,，導致了TCRγδ信號分離度變差（紅色箭頭）,。

接下來我們進一步明確兩者的概念：

Spillover（溢出）：

當熒光分子吸收光子時，會使電子躍遷至更高能級,，隨后釋放出能量較低（波長較長）的光子。該光子在可見光譜范圍內,。流式細胞儀不僅測量主檢測器中的熒光信號,，還會在一個或多個次級檢測器中檢測到信號，這種現(xiàn)象被稱為“Spillover（溢出）”,。

Spread（擴散）：

Spillover（溢出）造成了真實信號識別的困難（光譜的重疊）,。為了解決這個問題，傳統(tǒng)流式使用補償技術（compensation）,，光譜流式使用解混（unmix）技術,。然而，在溢出效應時,，數(shù)據(jù)的信號方差增加,，會影響信號的區(qū)分和檢測靈敏度。

為了更好地評估Spillover和Spread對實驗結果的影響,，我們需要使用一些專門的工具來對這兩個現(xiàn)象進行量化分析,。這些工具能夠幫助我們深入探討不同熒光染料在檢測器中的行為,，量化其對實驗數(shù)據(jù)的潛在影響。通過使用這些工具,，我們不僅可以更準確地設計實驗,，還能確保實驗結果的可靠性和精確性。接下來,，我們將詳細介紹兩個在量化這些現(xiàn)象時非常有用的工具,，它們將在流式細胞術實驗中發(fā)揮關鍵作用。

Spillover Spreading Matrix, SSM

（溢出擴散矩陣）

SSM 是一種定量工具,，用于衡量每個熒光染料的信號在不同檢測器中的擴散（spread）,。它提供了各熒光染料之間相互影響的完整矩陣信息，幫助識別可能導致數(shù)據(jù)不準確的信號重疊,。

Spread Quantification Index, SQI

（擴散量化指數(shù)）

SQI 是一個獨立于熒光染料濃度和檢測器類型的標準化指數(shù),，并且通過歸一化，SQI值獨立于檢測器的電壓/增益設置,，使其在不同儀器和實驗條件下具有可比性,。作為評估熒光染料在多色流式細胞實驗中的spread程度的工具，有助于優(yōu)化實驗設計,，減少數(shù)據(jù)誤差,，提高結果的可重復性和準確性。

圖4：SSM（溢出擴散（spread）矩陣）和 SQI（擴散（spread）量化指數(shù)）的概念與計算： (a)左圖部分,，首先計算Y軸上陽性和空白微球的標準差四分位數(shù),，并進行減法操作。此結果通過X軸上陽性和空白微球的中位數(shù)差進行歸一化,。所得結果為Intrinsic Spillover Spread (ISS),，這些數(shù)值顯示在溢出擴散（spread）矩陣中。 (b)右圖部分,，主要熒光染料X（在檢測器A）向檢測器B的溢出熒光導致了Y軸上的擴散（spread）,。擴散（spread）的量化是Y軸上99百分位數(shù)和50百分位數(shù)之間的差異，并乘以歸一化因子,，使得SQI值獨立于檢測器增益設置,。綠色線表示99百分位數(shù)的位置。

兩個工具的的主要差異可以總結為下表：

在光譜流式的配色設計中,，由于并不同于傳統(tǒng)流式,，熒光素對應某個熒光檢測通道，每個檢測通道都會收集所有熒光染料的信號,，再通過光譜解混（unmix）來分離重疊的光譜,，因此需要額外的工具來優(yōu)化配色方案。

Complexity Index（復雜性指數(shù)）

用于評估信號混雜和解混（unmix）的復雜程度,，幫助選擇較優(yōu)的熒光組合,，以減少復雜性,，確保多色實驗的有效性。

Similarity Matrix（相似性矩陣）

用于衡量熒光染料之間的光譜重疊程度,，避免選用光譜過于接近的染料組合,，從而減少解混（unmix）誤差，提高實驗精度,。

圖5：FluoroFinder 根據(jù)光譜流式細胞儀的配置和所選熒光染料生成參考Similarity Matrix（相似性矩陣）和參考 Complexity Index（復雜性指數(shù)）,。這些工具幫助用戶評估熒光染料之間的光譜重疊程度，并評估信號混雜和解混（unmix）的復雜性,。通過使用這些指標,，研究人員可以優(yōu)化多色配色方案，選擇最佳熒光組合,，減少解混（unmix）誤差,，確保實驗數(shù)據(jù)的準確性和可靠性。在同型號的不同配置儀器,，對于同樣的熒光素組合,，其參考矩陣不同，且參考Complexity Index（復雜性指數(shù)）也不同,。

通過精準掌握Spillover和Spread的概念,，以及巧妙運用SSM、SQI,、Complexity Index和Similarity Matrix等工具,，您不僅能在傳統(tǒng)流式細胞術中應對復雜的多色實驗設計，還能在光譜流式中游刃有余,。這樣,，您的實驗數(shù)據(jù)將更加可靠和高效。

CytoFLEX 系列流式細胞儀憑借其創(chuàng)新的雪崩光電二極管（APD）檢測器和卓越的光學設計,，實現(xiàn)了更低的SQI（Spread Quantification Index）,。APD 檢測器具有更高的靈敏度和更低的噪聲水平，能夠更精確地捕捉微弱的熒光信號,。這種設計減少了信號擴散（spread）和溢出效應，使得實驗結果更加穩(wěn)定和精確,。卓越的光學系統(tǒng)進一步優(yōu)化了信號檢測路徑,，確保了數(shù)據(jù)的高質量和可重復性，是多色流式細胞實驗的理想選擇,。

圖6：四種不同流式細胞儀中比較spread現(xiàn)象,；使用不同的單染色微球集群在四種不同儀器上運行。對每種組合計算了SQI值,。SQI值按以下范圍分類：1-120（綠色）,；121-199（黃色）,；200-299（橙色）；和300以上（紅色）,。

CytoFLEX流式細胞儀的補償庫設計極大地提升了多色實驗的準確性和效率,。通過預先建立和存儲多種熒光染料組合的補償設置，研究人員能夠快速應用適合的補償參數(shù),，減少手動調整的時間和誤差,。這不僅簡化了復雜的實驗設計過程，還確保了在多色分析中獲得一致且可靠的結果,，從而使得實驗更加精確和高效,。

圖7：CytoFLEX流式細胞儀在多色實驗中的補償調節(jié)工作流程。CytoFLEX通過其先進的補償庫設計,，使實驗過程更加高效和精準,。用戶僅需設定通道電壓或增益并收集單染管數(shù)據(jù)，系統(tǒng)便會自動計算補償矩陣,。在獲得補償庫后,，若需要調整，CytoFLEX能夠智能調整增益和電壓,，重新計算補償,，無需重復實驗步驟。相比傳統(tǒng)方法,，CytoFLEX的這一創(chuàng)新設計減少了實驗誤差,，大幅提升了實驗的可重復性和效率，為研究人員提供了更強大的實驗支持,。

在科學研究中,，概念與方法是實驗設計的基石，而先進的技術則是實現(xiàn)這一切的驅動力,。CytoFLEX流式細胞儀以其卓越的光學設計和智能化的補償庫,，為多色實驗帶來了前所未有的精確性和效率?？萍疾粌H是工具,，更是未來的指引者，推動著我們在探索未知的道路上不斷前行,。讓技術與科學相結合,，共同演繹出未來的無限可能。

● 文章來源：

Bhowmick, Debajit, and Timothy P. Bushnell. "How to Measure “Spillover Spread”." *Flow Cytometry Protocols*. New York, NY: Springer US, 2024. 69-83.Ferrer-Font, Laura, et al. "Panel Design and Optimization for Full Spectrum Flow Cytometry." *Flow Cytometry Protocols*. New York, NY: Springer US, 2024. 99-124.Zargaran, Sina, et al. "Practical 10‐Color T‐Cell Panel for Phenotyping Diverse Populations Using Spectral Flow Cytometry: A Beginner's Guide." *Current Protocols* 4.3 (2024): e1020.Ferrer‐Font, Laura, et al. "Panel optimization for high‐dimensional immunophenotyping assays using full‐spectrum flow cytometry." *Current Protocols* 1.9 (2021): e222.Bhowmick, Debajit, et al. "A gain and dynamic range independent index to quantify spillover spread to aid panel design in flow cytometry." *Scientific Reports* 11.1 (2021): 20553.Park, Lily M., Joanne Lannigan, and Maria C. Jaimes. "OMIP‐069: forty‐color full spectrum flow cytometry panel for deep immunophenotyping of major cell subsets in human peripheral blood." *Cytometry Part A* 97.10 (2020): 1044-1051.Nguyen, Richard, et al. "Quantifying spillover spreading for comparing instrument performance and aiding in multicolor panel design." *Cytometry Part A* 83.3 (2013): 306-315.Roederer, Mario. "Spectral compensation for flow cytometry: visualization artifacts, limitations, and caveats." *Cytometry: The Journal of the International Society for Analytical Cytology* 45.3 (2001): 194-205.

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