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杜邦全自動微生物基因指紋鑒定系統(tǒng)
杜邦全自動微生物基因指紋鑒定系統(tǒng)

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高準(zhǔn)確度、高分辨力的微生物鑒定和分子分型

基于您需求和優(yōu)越體驗的產(chǎn)品設(shè)計

RiboPrinter® System 全自動微生物基因指紋鑒定系統(tǒng)以微生物獨特的基因組為基礎(chǔ),可自動化同步完成菌株水平的鑒定和分子分型,,實現(xiàn)產(chǎn)品、環(huán)境,、設(shè)備,、人員等全方位的微生物風(fēng)險預(yù)警和污染溯源,。該系統(tǒng)擁有10多項**技術(shù),基本原理為限制性內(nèi)切酶長度多態(tài)性分析(RFLP)和分子印跡雜交(Southern Blot)分析,,可進(jìn)行但不局限于核糖體分型(Ribotyping)及其拓展應(yīng)用,,更可開展個性化的酶切、電泳和探針雜交研究,,滿足多種用途的應(yīng)用需求,。

該系統(tǒng)集成了RFLP,凝膠電泳,,Southern Blot,,標(biāo)準(zhǔn)菌株基因指紋圖譜數(shù)據(jù)庫和自動化生物信息學(xué)分析五大系統(tǒng),是全球**的全自動,、標(biāo)準(zhǔn)化微生物鑒定分型工作站,,是進(jìn)行快速、準(zhǔn)確,、高分辨力微生物菌株水平鑒定和分子分型的有力工具,。

屢獲大獎的RiboPrinter® 系統(tǒng)為食品、制藥,、第三方檢測,、政府監(jiān)管技術(shù)部門的用戶提供了一種快速簡便,同時又非常準(zhǔn)確和標(biāo)準(zhǔn)化的食品,、藥品和環(huán)境樣品的檢測手段,。

·8小時菌株水平核酸鑒定+分子分型同步完成

·全自動、高度標(biāo)準(zhǔn)化流程,,手工操作僅一步

·大容量專家數(shù)據(jù)庫,,經(jīng)權(quán)威驗證的8528條標(biāo)準(zhǔn)菌株信息

·未知微生物直接上機(jī)檢測和分析,無需預(yù)實驗

·支持多種限制性酶切及探針組合應(yīng)用,,可擴(kuò)展的微生物鑒定分型應(yīng)用平臺及服務(wù)

·出眾的廣譜分析和高分辨分型及溯源能力

·全自動生物信息學(xué)分析和數(shù)據(jù)管理

·交互式聯(lián)網(wǎng)架構(gòu),,快速構(gòu)建監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)和預(yù)警溯源平臺

·應(yīng)用領(lǐng)域廣泛

·微生物相關(guān)學(xué)科基礎(chǔ)研究

·食品、制藥,、個人護(hù)理用品安全

·人和動物的疾病預(yù)防與控制

·公共衛(wèi)生及微生物風(fēng)險評估與監(jiān)測

產(chǎn)品特點

RiboPrinter® 系統(tǒng)可快速分析微生物的全基因組DNA,,8小時內(nèi)同步完成菌株水平的核酸鑒定和分子分型,具有高準(zhǔn)確度,、高分辨力,、廣譜檢測、快速簡便和標(biāo)準(zhǔn)化的特點,,是常規(guī)檢測,、風(fēng)險評估和管理以及公共衛(wèi)生突發(fā)事件快速反應(yīng)的**方法,也是美國藥典 USP 推薦之微生物鑒定,、分型和溯源技術(shù),。

擁有10多項**技術(shù),,集成了DNA酶切、電泳,、印跡,、分子雜交、成像,、標(biāo)準(zhǔn)菌株數(shù)據(jù)庫和自動化生物信息學(xué)分析7大模塊,,是全球**的全自動,、標(biāo)準(zhǔn)化微生物鑒定和分型工作站,。

RiboPrinter® 系統(tǒng)的含金量超出常規(guī)鑒定或分型設(shè)備的范疇:

·高準(zhǔn)確度,基于微生物基因型特征檢測,,比傳統(tǒng)法表型方法更可靠

·8小時菌株水平的核酸鑒定+分子分型同步完成

·全自動標(biāo)準(zhǔn)化流程,,手工步驟僅一步,無需復(fù)雜的分子生物學(xué)操作,,對人員的資質(zhì)和培訓(xùn)要求低,,可**程度避免人為干擾和交叉污染風(fēng)險

·高分辨力,兼具廣譜分析和特定目標(biāo)菌的高分辨分型能力

·原位酶切,,高保真還原菌株的全基因組信息

·高通量,,8h工作時間可連續(xù)檢測32個樣品

·通用標(biāo)準(zhǔn)化試劑盒實現(xiàn)廣譜檢測需求,無需預(yù)實驗即可開展鑒定和分型,,同時方便試劑采購和應(yīng)急儲備,,避免過期造成浪費

·未知菌株直接上機(jī),無需知曉種屬信息即可開展分析

·支持多種限制性酶切及個性化探針應(yīng)用,,滿足您的高級應(yīng)用需求

·大容量數(shù)據(jù)庫含8528條標(biāo)準(zhǔn)菌株信息,,全部經(jīng)國際三大菌種保藏中心ATCC,JCM和DSMZ驗證,,數(shù)據(jù)沒有盲點和模糊點,,并持續(xù)更新

·成像模塊和分析軟件可自動將實際指紋圖像數(shù)字化,自動進(jìn)行條帶位移測算,、分子量測算和濃度測算,,優(yōu)化算法并輸出指紋圖譜及峰型圖,結(jié)果信息豐富,,滿足回顧性和預(yù)測性分析所需

·專家級數(shù)據(jù)庫和優(yōu)化算法確保了鑒定和分型結(jié)果的準(zhǔn)確性,,生物信息學(xué)分析功能可自動給出菌株比對、鑒定和相似性結(jié)果,,并自動聚類分析,,根據(jù)您的需求分成不同型別,完全避免主觀因素,,實現(xiàn)高分辨的菌株溯源

·兼容的電子數(shù)據(jù),,方便存儲,、分享和恢復(fù),并可與第三方數(shù)據(jù)分析軟件(如BioNumerics)對接,,實現(xiàn)不同平臺的數(shù)據(jù)比對和分析

·交互式聯(lián)網(wǎng)架構(gòu),,獨特的“一對一”,“一對多”和“多對一”數(shù)據(jù)系統(tǒng)架構(gòu),,助您快速構(gòu)建監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)和預(yù)警溯源平臺,。還可實現(xiàn)設(shè)備的遠(yuǎn)程訪問、操作和診斷,,即使身處辦公室亦可實時分析數(shù)據(jù),、監(jiān)控實驗狀態(tài)和進(jìn)展

菌株水平上的微生物鑒定和分子分型

RiboPrinter® 系統(tǒng)可對菌株進(jìn)行全基因組分析,在菌株水平上實現(xiàn)鑒定和分子分型同步完成,。其工作主要可分為三大步:全基因組酶切,,DNA片段分離和特異探針雜交目標(biāo)序列,全自動化的數(shù)據(jù)處理及生物信息學(xué)分析,。

全基因組酶切

限制性內(nèi)切酶可對細(xì)菌全基因組進(jìn)行酶切,,產(chǎn)生大量DNA片段。由于菌株之間存在同源性和變異性,,酶切不同種屬或不同株的基因組時,,酶切產(chǎn)物中就會存在相同或不同長度的DNA片段,通過特異探針雜交可解讀目標(biāo)DNA片段在分子水平上的差異,。

電泳,、Southern印跡、探針雜交目標(biāo)序列和生物信息學(xué)分析

全基因組酶切產(chǎn)物經(jīng)電泳后,,長短不一的片段DNA分離,,經(jīng)Southern印跡法轉(zhuǎn)印至膜上。經(jīng)標(biāo)記的高特異探針(6.5kb,,覆蓋核糖體16S,, 23S, 5S rRNA及其間隔序列和側(cè)翼序列)識別并與膜上的特異DNA片段雜交,。雜交產(chǎn)物經(jīng)化學(xué)發(fā)光后,,可在膜上產(chǎn)生位移、顏色不一的高分辨條帶(指紋圖譜),,經(jīng)軟件自動分析,,根據(jù)帶型和帶數(shù)的多態(tài)性對細(xì)菌進(jìn)行鑒定和分型。靈活的廣譜性和通用性應(yīng)用,,可方便用戶采用標(biāo)準(zhǔn)化的酶切方法和探針對多種不同的微生物進(jìn)行分析和比較,,高分辨性能確保系統(tǒng)能產(chǎn)生足夠數(shù)量條帶的指紋圖譜,且具備較高的分型力和良好的重復(fù)性。強(qiáng)大的數(shù)據(jù)分析能力使數(shù)據(jù)搜索,、分類,、報告和追溯等操作更為簡便和靈活,可建立個性化菌株信息庫,,實現(xiàn)更廣泛的應(yīng)用,。

傳統(tǒng)表型方法與16S測序方法在菌株的鑒定方面存在局限性,更無法在菌株水平開展分型分析,,這主要是因為這兩種方法的微生物分類水平較低,,只能鑒定到“屬”或“種”的水平,分辨力有限,;容易受到培養(yǎng)條件,、環(huán)境和培養(yǎng)物本身變異和多態(tài)性影響,準(zhǔn)確度有限,;16S 測序方法通常只檢測 16S rRNA 基因上高度保守的 500 個堿基或整個片段序列,,因此基因信息量有限,對于種間差異?。?6S 序列接近)的細(xì)菌,鑒定效果受到局限,,且依賴PCR擴(kuò)增技術(shù),,因此存在容易污染和非特異性擴(kuò)增問題,從而降低保真性和重現(xiàn)性,。

由于這些局限性,,使這兩種方法均無法達(dá)到“菌株水平”的分辨力,在風(fēng)險評估,、監(jiān)測和預(yù)警上的作用有限,。

RiboPrinter® 除了能分析16S序列,還能分析23S,,5S及其間隔和側(cè)翼50kb范圍內(nèi)的DNA序列,。如果使用個性化探針,還能將分析范圍拓展到全基因組水平,,能進(jìn)行高平行性的全基因組分子水平上的指紋分析,,使鑒定和分型的分辨率達(dá)到“菌株”水平,區(qū)分相似菌株的細(xì)微差別,。通過特異性酶切和探針設(shè)計的組合應(yīng)用,,還可實現(xiàn)更高分辨力和滿足更廣泛應(yīng)用的需求!

簡便,,卻不簡單

多種菌株分析應(yīng)用,,盡在一種全自動化方案!RiboPrinter® 系統(tǒng)的操作非常簡便,手工操作僅一步,,剩下的繁瑣步驟均由系統(tǒng)全自動完成,。但簡便并不意味著功能的減少,相反,,RiboPrinter® 系統(tǒng)可為您呈現(xiàn)更多有價值的信息:

·菌株種屬鑒定和高分辨分子分型,,可提供菌株的基本信息,鑒別相似菌株之間的細(xì)微差別,,適用于流行病學(xué)研究,,微生物風(fēng)險評估、監(jiān)測和污染溯源,,特殊菌株的篩選和驗證

·高分辨的指紋條帶兼具保守性(如屬特異條帶和16S rDNA保守條帶等)和多態(tài)性(如核糖體編碼基因上下游區(qū)域及間隔區(qū)內(nèi)的堿基突變所形成的條帶),。研究發(fā)現(xiàn),緊連核糖體基因的上下游區(qū)域在進(jìn)化中多處于中性,,這些管家基因(Housekeeping gene)常常是多位點序列分型(MLST)的分析位點,,這使RiboPrinter® 系統(tǒng)可用于分離株之間進(jìn)化遺傳相關(guān)性特征的分型分析,適用于系統(tǒng)發(fā)育,、 種群生物學(xué),、微生態(tài)學(xué)、微生物分類學(xué),、微生物生理學(xué),、遺傳學(xué)和分子生物學(xué)等研究

開放應(yīng)用平臺,滿足高分辨?zhèn)€性化研究需求

RiboPrinter® 系統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)化酶切和探針雜交方案在速度和分型力等參數(shù)之間進(jìn)行了優(yōu)化與平衡,,在滿足高分辨力的同時大幅提升了檢測速度,,可滿足大多數(shù)應(yīng)用需求,有效縮短了等待時間,。作為一個開放平臺,, RiboPrinter® 系統(tǒng)也為用戶提供了進(jìn)一步提升分型力和多元化應(yīng)用的可能。用戶有多種優(yōu)化的方法提升系統(tǒng)的分型能力,,或拓展更廣泛的應(yīng)用,。

如,用戶可選擇更特異的限制性酶切方案,,選擇在16S,, 23S或5S序列中有酶切位點的限制性內(nèi)切酶,這樣就可使圖譜的條帶數(shù)翻倍,。

或,,采用混合酶切方案,即同時使用或按順序使用2種或2種以上的限制性內(nèi)切酶,,達(dá)到理想的分型效果,。

還可,,選擇管家基因或其他任何您所感興趣的分子探針。研究表明,,在菌株基因組內(nèi)核糖體操縱子上下游片段中存在非常保守的管家基因,針對這些特異序列設(shè)計探針,,可大大增加指紋圖譜的分型力,。用戶甚至可針對基因組內(nèi)其他兼具保守性和多態(tài)性的位點設(shè)計探針,滿足個性化研究的需求,!

強(qiáng)大而靈活的交互式聯(lián)網(wǎng)平臺

RiboPrinter® 系統(tǒng)強(qiáng)大的聯(lián)網(wǎng)應(yīng)用和數(shù)據(jù)架構(gòu)非常適合快速構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)化應(yīng)用平臺,,兼容的電子數(shù)據(jù)可方便的管理和導(dǎo)入第三方分析軟件:

·獨特的“一對一”,“一對多”和“多對一”數(shù)據(jù)系統(tǒng)架構(gòu),,助您快速構(gòu)建監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)和應(yīng)用平臺

·無需樣品轉(zhuǎn)移,,所有檢測均可在就近的網(wǎng)絡(luò)實驗室進(jìn)行,標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù)可通過自動或手動的方式傳輸?shù)街行姆?wù)器

·中心服務(wù)器負(fù)責(zé)所有信息的處理及保存,,也可完成遠(yuǎn)程終端的數(shù)據(jù)處理要求

·來自各個網(wǎng)絡(luò)實驗室的數(shù)據(jù)可在中心服務(wù)器進(jìn)行匯總比對,,進(jìn)一步優(yōu)化算法,形成更大的,、更可靠的菌株信息庫

·標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù)可方便地共享、管理或?qū)拥谌椒治鲕浖ㄈ鏐ioNumerics)

支持多賬戶創(chuàng)建和密碼保護(hù),,支持設(shè)備的遠(yuǎn)程訪問,、操作和診斷,,即使身處辦公室亦可實時分析、監(jiān)控狀態(tài)和進(jìn)展

高性能系統(tǒng),,靈活應(yīng)用多面手

食品、制藥,、個人護(hù)理用品生產(chǎn)質(zhì)控和質(zhì)保

·RiboPrinter® 系統(tǒng)可快速、準(zhǔn)確,、高分辨地鑒定和分型產(chǎn)品或環(huán)境中的分離到的微生物并追溯源頭,,幫助管控微生物污染風(fēng)險,,完全滿足法規(guī)要求,,提升品牌價值

·高通量,流程時間優(yōu)化,,全自動操作和數(shù)據(jù)分析等特點可縮短產(chǎn)品放行時間,,減少庫存,并降低對實驗員資質(zhì)和培訓(xùn)的依賴

·高準(zhǔn)確度和分辨力有助于風(fēng)險監(jiān)測,建立評估,、干預(yù)等措施

疾病網(wǎng)絡(luò)化監(jiān)測與風(fēng)險評估

·RiboPrinter® 系統(tǒng)可高準(zhǔn)確,、高分辨地分析各種食品和環(huán)境樣品中分離的已知或未知致病菌,明確其相關(guān)性,,標(biāo)準(zhǔn)化和個性化的試劑盒及流程可滿足網(wǎng)絡(luò)化監(jiān)測和風(fēng)險評估的需求

·快速,、高通量、標(biāo)準(zhǔn)化和全自動的流程可有效提升實驗員的工作效率,,并減少人間差異和交叉污染對監(jiān)測和評估的影響

·通過世界權(quán)威機(jī)構(gòu)的驗證,,更有公信力的菌株數(shù)據(jù)信息

食物中毒調(diào)查及疾病預(yù)防和控制

·RiboPrinter® 系統(tǒng)可在*短時間內(nèi)大規(guī)模篩查可疑樣品,,明確污染源和傳染關(guān)系,,并阻斷其傳播途徑

·高準(zhǔn)確、高分辨和廣譜性能有助于分析并確認(rèn)可疑菌株,,尤其對于表型法難檢或未知菌株有較好的鑒定和分型能力

·通過權(quán)威驗證的數(shù)據(jù),,尤其適用于暴發(fā)時的應(yīng)急檢測和快速反應(yīng),可靠性有保障

院內(nèi)感染調(diào)查和干預(yù)

·RiboPrinter® 系統(tǒng)可快速,、準(zhǔn)確,、高分辨地病人和醫(yī)院環(huán)境樣品中的危險致病菌及其相關(guān)性,找出導(dǎo)致院內(nèi)感染的關(guān)鍵環(huán)節(jié),,建立實時監(jiān)控和高效干預(yù)體系

·廣譜分析能力有助于在復(fù)雜的微生物環(huán)境中發(fā)現(xiàn)潛在或未知危險,,從而從源頭降低院內(nèi)感染風(fēng)險

·全自動分析和高效流程可減少實驗員的負(fù)擔(dān)及對其資質(zhì)的要求

功能菌株篩選,研發(fā)及微生物相關(guān)學(xué)科基礎(chǔ)研究

·RiboPrinter® 系統(tǒng)先進(jìn)的檢測原理和方法學(xué)優(yōu)化能廣泛地滿足各個領(lǐng)域微生物研究的需求,,更能為個性化研究提供平臺和解決方案顯著提升研究效率

·全自動流程和分析,,無需核酸提取和純化,能有效避免主觀因素,,減少人為干擾和交叉污染風(fēng)險,,獲得高穩(wěn)定性和重現(xiàn)性結(jié)果

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