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PsychoFish 可用于成年斑馬魚(3 月齡)或幼年斑馬魚(1-2 月齡)群體凝聚力及個(gè)體運(yùn)動(dòng)能力及趨勢(shì)兩方面的研究,。
系統(tǒng)組成
其包含以下3 個(gè)組成部分:
1. 機(jī)械單元
2. 圖像采集系統(tǒng)
3. 數(shù)據(jù)顯示,、存儲(chǔ)、分析硬件/軟件
PsychoFish 系統(tǒng)有如下特點(diǎn):
1. 設(shè)計(jì)精巧,,方便安裝和拆卸,;
2. 126*50*125cm 鋁制框架構(gòu)成機(jī)械單元基座,穩(wěn)定性高,;
3. *多4 個(gè)10*20*5cm 大小斑馬魚池可被同時(shí)放置于基座進(jìn)行實(shí)驗(yàn),;
4. 基座表面為乳白色玻璃材質(zhì),保證其上方魚池均勻的光線分布,;
5. 提供兩種不同的照明方式:下方白色背景燈照明和上方下拉式照明,,滿足不同實(shí)驗(yàn)需求;
6. 圖像采集器包含前后雙攝像頭,,置于機(jī)械單元鋁制水平桿上,,提供全方位的圖像采集;
7. KOMI 圖像分析程序可從群體凝聚力和運(yùn)動(dòng)強(qiáng)度兩方面分析采集到的圖像,,高效便利,。
數(shù)據(jù)處理及分析
(1)斑馬魚群體凝聚力分析
觀測群里凝聚力時(shí),需要考慮多方面的因素,,包括空間需求,、水深、個(gè)體數(shù)目或群體規(guī)模等,,PsychoFish 建議在深度為2cm 的水中進(jìn)行測試,。測試時(shí),位于機(jī)械單元水平桿上的前后攝像頭可記錄每一斑馬魚個(gè)體的運(yùn)動(dòng)情況,,拍攝成一系列的圖片,,然后通過KOMI 程序進(jìn)行分析即可。圖片拍攝,、魚池尺寸和數(shù)目等參數(shù)可通過軟件面板進(jìn)行設(shè)置,。
視頻采集過程中,,軟件使用圖解和數(shù)值計(jì)算的方式自動(dòng)對(duì)采集的圖像進(jìn)行分析,得到各種評(píng)價(jià)斑馬魚群行為學(xué)的數(shù)據(jù),。軟件識(shí)別圖像中的斑馬魚個(gè)體并用白色十字標(biāo)記,,所有呈現(xiàn)于屏幕的斑馬魚個(gè)體可形成一區(qū)域多邊形,多邊形面積,、斑馬魚個(gè)體間距等數(shù)據(jù)即可用于反映魚群群體凝聚力大小,。
軟件分析過程中,以下計(jì)算數(shù)據(jù)可輸出至Excel 表格中:
? 多邊形的面積
? *長對(duì)角線長度
? 重心的坐標(biāo)(相對(duì)于實(shí)驗(yàn)區(qū)域中點(diǎn)位置)
? 重心距離參照點(diǎn)的距離
? 個(gè)體間的距離:包括*近距離,、*遠(yuǎn)距離,、平均距離
? 魚對(duì)之間的平均距離
(2)個(gè)體運(yùn)動(dòng)能力及趨勢(shì)分析
個(gè)體運(yùn)動(dòng)能力測試建議水深2cm,*多四個(gè)魚池同時(shí)測試,。測試期間,,機(jī)械
單元上的攝像頭可記錄每個(gè)斑馬魚個(gè)體的運(yùn)動(dòng)情況,并保存一系列圖片,,通過對(duì)
圖片的識(shí)別和分析得到其運(yùn)動(dòng)能力和趨勢(shì)數(shù)據(jù),。圖片拍攝、魚池尺寸和數(shù)目等參
數(shù)可通過軟件面板進(jìn)行設(shè)置,。
視頻采集過程中,,軟件使用圖解和數(shù)值計(jì)算的方式自動(dòng)對(duì)采集的圖像進(jìn)行分析,得到各種評(píng)價(jià)斑馬魚群行為學(xué)的數(shù)據(jù),。軟件識(shí)別圖像中的斑馬魚個(gè)體并用彩色十字標(biāo)記,,被標(biāo)記的斑馬魚個(gè)體以及其運(yùn)動(dòng)軌跡會(huì)呈現(xiàn)于分析窗口。同時(shí),,所有斑馬魚運(yùn)動(dòng)速度及路程也會(huì)被計(jì)算并輸出至Excel 表格中,。
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